RM1 股骨内接种小鼠骨髓单细胞测序

资源简介

RM1 股骨内接种小鼠骨髓单细胞测序

GSE330265 是一个聚焦于肿瘤诱导骨痛机制的小鼠骨髓单细胞测序数据集，全称为 Murine Bone Marrow Single Cell Sequencing of RM1 Intrafemoral Inoculation。该数据集通过 10x Genomics scRNAseq 技术对 RM1 股骨内接种模型的小鼠骨髓进行单细胞水平表达谱分析，旨在研究骨髓在癌症诱导骨痛中的作用。骨髓被认为是感觉神经元与疼痛信号传导的重要介导者，该数据集为肿瘤负荷状态下的骨髓研究建立了参考数据基础。数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，归属于肿瘤/其他分类，包含 1 个数据文件，由 Yusuke 与 Shiozawa 于 May 07 202 发布，主题标签涵盖高通量测序表达谱分析、GPL19057 平台以及小鼠物种编号 10090。

【数据集背景】

该数据集围绕癌症诱导骨痛这一病理过程展开。骨痛是肿瘤骨转移患者常见的严重并发症，而骨髓作为感觉神经元与疼痛信号传导的介导者，在其中的作用尚需深入解析。研究者采用 RM1 细胞系进行股骨内接种，构建肿瘤-bearing 小鼠模型，并利用单细胞测序手段刻画骨髓微环境在肿瘤存在条件下的细胞组成与表达特征。源站描述指出，该研究旨在探究小鼠骨髓对癌症诱导骨痛的贡献，相关发现确立了肿瘤-bearing 参考数据集。该数据集所属分类为肿瘤/其他，体现了其跨肿瘤生物学与神经感觉研究的交叉属性。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件，样例文件名为 GSE330265_series_matrix.txt.gz，为 GZIP 压缩格式。该文件以矩阵形式组织，通常涵盖样本层面的表达信息。数据集采用 10x Genomics scRNAseq 技术，属于 Expression profiling by high throughput sequencing 类型，平台标识为 GPL19057，物种为小鼠（10090）。源站描述强调骨髓是感觉神经元和疼痛信号的介导者，并指出这些发现建立了肿瘤-bearing 参考数据集。除上述信息外，源站未提供更详细的细胞数量、基因数量、聚类结果或差异表达基因列表。

【采集与来源】

数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为 Murine Bone Marrow Single Cell Sequencing of RM1 Intrafemoral Inoculation。作者为 Yusuke 与 Shiozawa，发布时间为 May 07 202。主题标签包括 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL19057 和 10090。数据集通过 RM1 股骨内接种小鼠模型获取骨髓样本，并采用 10x Genomics scRNAseq 进行单细胞转录组测序。关于样本采集的具体时间点、动物数量、伦理审批信息以及测序深度等细节，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肿瘤诱导骨痛机制研究、骨髓微环境在肿瘤条件下的细胞组成分析，以及感觉神经元与疼痛信号传导相关的基础研究。由于采用单细胞测序技术，可用于探索骨髓中不同细胞类型的表达特征。此外，该数据集可作为肿瘤-bearing 状态的参考数据，用于比较或整合分析。其分类为肿瘤/其他，也可服务于肿瘤学与神经科学的交叉研究场景。关于具体分析流程、细胞类型注释或通路富集结果，源站未提供。

【使用方法】

使用该数据集时，可下载数据文件 GSE330265_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包，需按相应格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入。由于文件为矩阵格式，通常包含样本与表达值信息，读取后可根据研究目的进行质控、标准化及下游分析。关于是否提供配套的细胞注释文件、元数据表或分析代码，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集仅包含 1 个文件，文件样例为 GSE330265_series_matrix.txt.gz。源站未提供关于测序质量、细胞存活率、批次效应或技术重复的详细信息。由于仅有一个数据文件，可能限制了对多样本或不同实验条件的比较分析。此外，源站未提供详细的实验设计、样本分组或统计方法说明。使用者在解释结果时需注意这些限制，并结合自身分析需求评估数据适用性。

【引用与许可】

该数据集的作者为 Yusuke 与 Shiozawa，发布时间为 May 07 202。来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于具体的引用格式、许可条款或使用限制，源站未提供。使用者应参考源站页面获取最新的引用与许可信息。