肿瘤靶向自毁细菌原位生成免疫刺激性细菌裂解物用于癌症治疗

数据围绕肿瘤靶向自毁细菌原位生成免疫刺激性细菌裂解物这一治疗策略,可用于研究细菌裂解物对肿瘤细胞的免疫激活与细胞毒性作用,以及相关基因表达变化(来源 NCBI)

geo
浏览 19
基因组分类GPL2424710090
GSE324791: In situ generation of immunostimulatory bacterial lysates by tumor-targeted self-destructive bacteria for cancer therapy

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

肿瘤靶向自毁细菌原位生成免疫刺激性细菌裂解物用于癌症治疗

In situ generation of immunostimulatory bacterial lysates by tumor-targeted self-destructive bacteria for cancer therapy

该数据集来自 NCBI GEO,标题为“In situ generation of immunostimulatory bacterial lysates by tumor-targeted self-destructive bacteria for cancer therapy”,包含 1 个文件 GSE324791_series_matrix.txt.gz,属于高通量测序表达谱数据,平台为 GPL24247,物种为 10090。数据围绕肿瘤靶向自毁细菌原位生成免疫刺激性细菌裂解物这一治疗策略,可用于研究细菌裂解物对肿瘤细胞的免疫激活与细胞毒性作用,以及相关基因表达变化(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Mar 13 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):细菌疗法因其天然的肿瘤趋向性而在癌症治疗中引起了相当大的兴趣。然而,与活菌给药相关的安全性问题限制了其临床转化。在此,我们提出了一种基于裂解物的治疗策略,该策略保留了细菌的免疫刺激能力,同时最大限度地降低了与细菌增殖相关的风险。对多种细菌裂解物的系统评估确定,Escherichia coli Nissle 1917 (EcN) 裂解物是一种有效的抗肿瘤免疫诱导剂,既通过凋亡和坏死对肿瘤细胞表现出直接细胞毒性,又具有强大的免疫激活能力。基于这一发现,我们通过 ROS/GSH 双响应连接子将广谱抗生素氯霉素 (CAP) 偶联到巨噬细胞膜伪装的 EcN 上,从而设计了一种肿瘤响应性细菌平台 CAP-MM@EcN。巨噬

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE324791

【使用注意】

· 源站最后修改于 Oct 01 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE324791

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

细菌疗法因其天然的肿瘤趋向性而在癌症治疗中引起了广泛关注。然而,与活菌给药相关的安全性问题限制了其临床转化。在此,我们提出了一种基于裂解物的治疗策略,该策略保留了细菌的免疫刺激能力,同时最大限度地降低了与细菌增殖相关的风险。对多种细菌裂解物的系统评估发现,大肠杆菌Nissle 1917(EcN)裂解物是一种强效的抗肿瘤免疫诱导剂,既可通过凋亡和坏死对肿瘤细胞产生直接细胞毒性,又具有强大的免疫激活能力。基于这一发现,我们通过ROS/GSH双响应连接子将广谱抗生素氯霉素(CAP)偶联到巨噬细胞膜伪装的EcN上,构建了一种肿瘤响应性细菌平台CAP-MM@EcN。

巨噬细胞膜涂层增强了全身生物相容性和肿瘤蓄积,而肿瘤微环境中升高的氧化还原信号触发抗生素的局部释放,诱导细菌自溶并同时根除内源性肿瘤内细菌,从而实现免疫原性细菌裂解物的原位生成。这种自毁性细菌激活通过促进M1型巨噬细胞极化、树突状细胞成熟和细胞毒性T细胞活化,重塑了免疫抑制性肿瘤微环境。在多种小鼠肿瘤模型中,CAP-MM@EcN引发了强效的抗肿瘤反应,肿瘤抑制率达到87.5%,展示了一种安全有效的细菌介导癌症免疫治疗策略。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。