新型小分子PP2A激活剂激活神经母细胞瘤中的PP2A

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE317934

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

PP2A负向调控扩增的癌基因及促进侵袭性神经母细胞瘤的蛋白质，其中PP2A功能缺失导致磷酸化BRD4和组蛋白乙酰化增加，引起染色质松弛及随后的基因转录。我们假设PP2A再激活将阻止此类蛋白质/辅因子的结合，导致乙酰化组蛋白减少，使染色质变得紧密且无法结合MYCN及其他转录因子或调控因子，从而抑制MYCN的转录。我们拟评估PP2A激活后的差异基因表达，并在MYCN扩增细胞SK-N-BE(2)中鉴定MYCN下游靶点，因为MYCN扩增肿瘤在临床上治疗最为困难。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。