ALDH1B1 抑制诱导 Panc 10.05 细胞转录组变化的 RNAseq 分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE309927

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

ALDH1B1 是一种线粒体乙醛脱氢酶，是干细胞样结直肠癌和胰腺癌细胞存活所必需的，也是一个有前景的药物靶点。我们开发了一种优化后的 ALDH1B1 选择性抑制剂 IGUANA-5（IG5），并表征了 IG5 在胰腺癌细胞系 Panc 10.05 中诱导的转录组变化。IG5 在 Panc 10.05 细胞中诱导的基因包括与线粒体呼吸和胆固醇生物合成相关的基因。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。