GSE307553：伴克隆性造血的甲状腺癌可靶向治疗耐药 [EMseq_Macs_5hmC_PSV816_Project14046DH]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE307553

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数据说明

甲状腺未分化癌（ATC）是一种临床侵袭性强、预后极差的恶性肿瘤。BRAF/MEK联合抑制可为BRAFV600E突变型ATC患者带来显著治疗获益。然而，复发很常见，总生存期仍不理想。与分化型甲状腺癌相比，ATC的一个标志是明显的髓系细胞浸润，尤其是巨噬细胞。ATC最常见于老龄人群，而该人群TET2突变型克隆性造血（CH）的发生率也升高。已证明CH突变型巨噬细胞可加速CH相关病理生理过程，包括动脉粥样硬化。然而，CH突变克隆对实体瘤生物学、预后和治疗反应的临床及机制作用尚未阐明。在此，我们表明TET2突变型CH在实体瘤患者的肿瘤微环境中富集，并与ATC患者的不良预后相关。我们发现Tet2突变型巨噬细胞选择性浸润小鼠BrafV600E突变型ATC，并且其Tgfβ家族配体的过表达介导对BRAF/MEK抑制的耐药。

重要的是，抑制TGF-β信号传导可恢复对MAPK通路抑制的敏感性，为改善伴有并发CH的ATC患者的预后开辟了协同治疗策略的途径。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。