GSE307502：OCIAD2 在人多能干细胞中内胚层特化过程中促进上皮间质转化

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE307502

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

线粒体蛋白OCIAD2在多种癌症和神经退行性疾病中表达异常。然而，对其生理功能的认识，尤其是在干细胞分化背景下的作用，仍未被探索。我们的分析表明，OCIAD2在未分化的人胚胎干细胞（hESCs）中表达，并在中内胚层特化过程中上调。通过对基于CRISPR-Cas9的OCIAD2敲除和组成型表达OCIAD2的hESC系进行批量转录组分析，我们发现OCIAD2的调节不影响干细胞身份，但会改变其中内胚层分化潜能。我们的结果强调，OCIAD2调控TGFβ、AKT、BMP信号通路，从而在多能干细胞早期中内胚层特化过程中促进上皮向间充质转化。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。