HCoV-229E N蛋白磷酸化数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE306496

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本实验旨在鉴定并比较感染人冠状病毒229E（HCoV-229E，野生型）或基因工程改造的HCoV-229E突变体的Huh-7细胞（人肝癌细胞）中宿主基因表达的变化。这些突变体中，结构N蛋白的磷酸化状态已通过两个突变体各自的两个Ser-to-Ala联合替换而改变（分别为S147A+S149A和S364A+S367A）。对于这两个N蛋白突变体，各自分离出两个独立的分子克隆并用于本实验。这两个N蛋白突变体在细胞中生长至（略低或中等程度降低的）滴度，但尚不清楚核衣壳蛋白各自的磷酸化是否（以及在多大程度上）影响HCoV-229E感染后的细胞转录组。所有实验均在33°C下进行，这是该病毒高效复制所必需的条件。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。