口腔潜在恶性疾患恶变分子决定因素

该数据集来自NCBI GEO,聚焦口腔潜在恶性疾患(OPMDs)向恶性肿瘤转化的分子决定因素。研究基于为头颈鳞状细胞癌(HNSCC)开发的六亚型分类系统对样本进行分子分层,识别出Cl3-Hypoxia亚型为高风险,中位恶变时间30.1个月,并探讨瘤内微生物群与炎症基因特征的交互及其与恶性进展的关联

geo
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基因组预测GPL185739606
GSE302239: Molecular determinants of transformation in oral potentially malignant disorders

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-26

资源简介

口腔潜在恶性疾患恶变分子决定因素

Molecular determinants of transformation in oral potentially malignant disorders

该数据集来自NCBI GEO,聚焦口腔潜在恶性疾患(OPMDs)向恶性肿瘤转化的分子决定因素。研究基于为头颈鳞状细胞癌(HNSCC)开发的六亚型分类系统对样本进行分子分层,识别出Cl3-Hypoxia亚型为高风险,中位恶变时间30.1个月,并探讨瘤内微生物群与炎症基因特征的交互及其与恶性进展的关联。数据含1个表达谱矩阵文件,可用于恶变风险预测与肿瘤微环境相关研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jul 10 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):本研究考察口腔潜在恶性疾患(OPMDs)的恶变风险,包括白斑、红斑、增殖性疣状白斑和口腔黏膜下纤维化。尽管病变大小和异型增生分级等因素已被评估,但均未被证明是癌症发生的可靠预测指标。基于为头颈鳞状细胞癌(HNSCC)开发的六亚型分类系统,样本被进行分子分层。其中,Cl3-Hypoxia亚型被确定为特别高风险,中位恶变时间为30.1个月。研究还调查了瘤内微生物群的存在及其与炎症基因特征的相互作用,两者均显示与恶性进展有显著关联。这些见解强调了肿瘤微环境的关键作用

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL18573、9606。本站分类:肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE302239

【使用注意】

· 源站最后修改于 Oct 23 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究探讨了口腔潜在恶性疾患(OPMDs)的恶变风险,如白斑、红斑、增殖性疣状白斑及口腔黏膜下纤维化。尽管病变大小和异型增生分级等因素已被评估,但尚无一项被证实能可靠预测癌症的发生。基于为头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)开发的六亚型分类系统,对样本进行了分子分型。其中,Cl3-缺氧亚型被确定为特别高风险,其中位恶变时间为30.1个月。该研究还调查了瘤内微生物群的存在及其与炎症基因特征的相互作用,两者均显示与恶性进展存在显著关联。这些见解强调了肿瘤微环境——特别是缺氧和微生物动态——的关键作用,并为预防高风险OPMD病例恶变提出了潜在的生物标志物和治疗策略。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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