PRMT5活性维持组蛋白生成以维护基因组完整性

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE301721

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数据说明

组蛋白将DNA包装成核小体，形成染色质，从而维护基因组完整性。组蛋白的适当表达对细胞增殖和染色质组织至关重要，然而组蛋白供应的上游调控因子仍未被完全理解。PRMT5——一种细胞必需的II型蛋白质精氨酸甲基转移酶，在癌症中常过度表达——催化精氨酸残基的对称二甲基化。利用时间分辨的新生转录谱分析、定量蛋白质组学和高分辨率成像，我们显示PRMT5活性是在S期维持组蛋白转录和组蛋白蛋白质合成所必需的。抑制或敲低PRMT5会导致组蛋白mRNA迅速耗竭、组蛋白蛋白质丢失以及复制相关核异常的积累。我们进一步显示，抑制PRMT5后，可溶性组蛋白H4在组蛋白基因座小体（HLBs）处积累，并且PRMT5底物H4精氨酸3突变体比野生型H4更强烈地定位到HLBs。这些发现支持一个模型，即PRMT5介导的组蛋白H4甲基化调控组蛋白转录。

我们的研究结果确立了PRMT5作为组蛋白稳态的核心协调者，并为其在增殖细胞中的关键作用提供了机制上的合理解释。在本实验中，我们测试了PRMT5抑制是否诱导组蛋白H3K4me3变化或H3K27me3异染色质扩散。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。