α-酮戊二酸核特异性还原羧化驱动组蛋白乙酰化诱导FOXA1依赖基因激活 [MB-231 ATAC]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE301095

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

线粒体始终处于细胞代谢的核心位置，而细胞核则整合细胞信号与环境信号以激活基因。然而，直接将细胞代谢与基因调控联系起来的机制尚不明确。在本研究中，我们聚焦于解析细胞核内控制组蛋白乙酰化的代谢通路，并鉴定出一种“兼职”机制：通过线粒体酶——乌头酸酶（ACO2）和异柠檬酸脱氢酶（IDH2）的核内定位，引导局部乙酰辅酶A池的丰度。在分离的细胞核中进行代谢示踪研究，发现由IDH2和ACO2催化的α-酮戊二酸还原性羧化可快速合成柠檬酸，从而增加乙酰辅酶A池。遗传学和蛋白质组学分析揭示，核内IDH2和ACO2与KAT2A形成复合物以进行组蛋白乙酰化，这增加了染色质可及性，并招募先锋因子FOXA1以激活增殖基因MKI67。在多种小鼠癌症模型中，ACO2和IDH2核内表达的增加足以形成侵袭性肿瘤，表明IDH2-ACO2-KAT2A轴具有致瘤潜力。

总之，我们的研究揭示了一种范式，即核内代谢途径与组蛋白乙酰化相耦合，共同调控基因表达，从而加剧了肿瘤的过度增殖表型。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。