GSE29988:HIF在FH相关肾肿瘤中的作用
研究利用条件性Fh1敲除小鼠模型,该模型可发生肾囊肿并过表达Hif-1a,通过与条件性Hif-1a敲除小鼠杂交,旨在识别Hif-1a在囊肿形成中的贡献

基本信息
资源简介
GSE29988:HIF在FH相关肾肿瘤中的作用
The role of HIF in FH-associated renal neoplasia
该数据集来自NCBI GEO,标题为“HIF在FH相关肾肿瘤中的作用”,包含1个文件(GSE29988_series_matrix.txt.gz),采用表达谱芯片(GPL6887,小鼠10090)检测。研究利用条件性Fh1敲除小鼠模型,该模型可发生肾囊肿并过表达Hif-1a,通过与条件性Hif-1a敲除小鼠杂交,旨在识别Hif-1a在囊肿形成中的贡献。数据可用于分析FH缺失相关肾肿瘤中HIF-1a的作用及基因表达变化(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jun 15 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):延胡索酸水合酶(FH)突变易导致肾囊肿和癌症。这些癌症过表达缺氧诱导因子-α(Hif-1a)。我们已构建条件性Fh1(小鼠FH)敲除小鼠,该小鼠发生肾囊肿并过表达Hif-1a。为了确定Hif-1a对囊肿形成的贡献,我们将该小鼠与条件性Hif-1a敲除小鼠进行了杂交。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL6887、10090。本站分类:肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE29988
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jan 16 201,引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
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- OpenDataLab:
数据说明
延胡索酸水合酶(FH)突变易导致肾囊肿癌。这些癌症过表达缺氧诱导因子-α(Hif-1a)。我们已经培育出条件性Fh1(小鼠FH)敲除小鼠,这些小鼠会发展出肾囊肿并过表达Hif-1a。为了确定Hif-1a在囊肿形成中的作用,我们将这些小鼠与条件性Hif-1a敲除小鼠进行了杂交。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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