孤儿药nitisinone联合sorafenib协同增强MSS结直肠癌抗PD-1疗效[RNA-Seq]

数据围绕孤儿药nitisinone联合sorafenib在MSS结直肠癌中协同增强抗PD-1疗效的研究,涉及细胞、类器官及小鼠移植模型等实验体系

geo
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基因组分类GPL246769606
GSE299214: Orphan drug nitisinone combined with sorafenib synergistically boosts anti-PD-1 efficacy in MSS Colorectal Cancer [RNA-Seq]

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-26

资源简介

孤儿药nitisinone联合sorafenib协同增强MSS结直肠癌抗PD-1疗效[RNA-Seq]

Orphan drug nitisinone combined with sorafenib synergistically boosts anti-PD-1 efficacy in MSS Colorectal Cancer [RNA-Seq]

该数据集来自NCBI GEO,标题为GSE299214,包含1个文件GSE299214_series_matrix.txt.gz,属于高通量测序表达谱数据,物种为9606(人类),平台为GPL24676。数据围绕孤儿药nitisinone联合sorafenib在MSS结直肠癌中协同增强抗PD-1疗效的研究,涉及细胞、类器官及小鼠移植模型等实验体系。可用于分析联合治疗下的基因表达变化,探索mtDNA-cGAS-STING轴及NK细胞相关机制,为MSS结直肠癌免疫治疗策略研究提供转录组数据支持(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jun 06 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):我们揭示,靶向HPD酶的FDA批准酪氨酸分解抑制剂nitisinone与sorafenib在MSS CRC细胞、类器官和小鼠异种移植中发挥协同生长抑制作用。利用PBMCs与自体肿瘤类器官共培养、原位移植模型、多重免疫染色和scRNA-seq,我们验证nitisinone与sorafenib联合以依赖mtDNA-cGAS-STING轴的方式协同增强抗PD-1疗效,并招募和激活NK细胞。总体而言,“三联”疗法(nitisinone+sorafenib+抗PD-1)不仅取得优异治疗效果,而且具有良好安全性,可能促进nitisinone在未来MSS CRC治疗策略中的扩大适应症。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/其他。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE299214

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jun 30 202,引用时请注意版本时效。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE299214

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  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
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  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们发现,尼替西农(nitisinone)——一种经FDA批准、靶向HPD酶的酪氨酸分解代谢抑制剂——与索拉非尼在MSS结直肠癌细胞、类器官及小鼠异种移植瘤中发挥协同生长抑制作用。通过外周血单核细胞(PBMC)与自体肿瘤类器官共培养、原位移植模型、多重免疫染色及单细胞RNA测序(scRNA-seq),我们验证了尼替西农与索拉非尼联合可协同增强抗PD-1疗效,且该作用依赖于mtDNA-cGAS-STING轴,并招募和激活NK细胞。总体而言,“三联”疗法(尼替西农+索拉非尼+抗PD-1)不仅取得了优异的治疗效果,还具有良好安全性,有望推动尼替西农在未来MSS结直肠癌治疗策略中扩大适应症。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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