HNRNPH1介导剪接事件调控EIF4G1转录变体组成及AURKA 5'UTR组织

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE298883

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数据说明

HNRNPH1是可变剪接的调控因子，但界定其所介导剪接事件的研究较少。本研究采用短读长和长读长RNA测序技术，探究HNRNPH1敲低对全转录组的影响及其对特定剪接事件的调控。差异可变剪接分析揭示了其对转录组的影响涉及所有剪接事件类别。我们证实了HNRNPH1对涉及TCF3外显子18a和18b的剪接事件的调控，这两个外显子编码不同的TCF3转录因子异构体。在此基础上，我们提供证据表明在神经母细胞瘤中，HNRNPH1是MYCN的靶标，这可能解释了该肿瘤类型中HNRNPH1和TCF3外显子18a转录变体水平较高的现象。对两个外显子跳跃事件的分析表明，HNRNPH1调控编码EIF4G1翻译起始因子N端部分的外显子以及包含在编码有丝分裂激酶AURKA的特定转录变体5‘UTR中的外显子的剪接。利用报告基因构建体，我们证明该AURKA 5’UTR外显子可增强表达，提示HNRNPH1可能参与调控AURKA蛋白水平。

我们的发现强调了HNRNPH1在调控具有多种细胞功能的蛋白质表达中的作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。