RAD21通过激活ERK1/2信号重塑H3K4me3修饰驱动肺腺癌进展

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE294135

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

RAD21是黏连蛋白复合体的核心单元，参与细胞的转录调控。RAD21的高频拷贝数扩增在多种癌症类型中普遍存在，并与高mRNA水平呈正相关，如肺腺癌（LUAD）。然而，其在LUAD中的作用尚不清楚。我们发现RAD21是LUAD患者的不良预后因素。在功能上，使用shRNAs敲低RAD21会损害LUAD细胞的增殖和转移能力。转录组测序揭示，RAD21缺失使LUAD细胞系中的上皮-间质转化（EMT）和MAPK信号通路失活，而外源性RAD21可挽救这一效应。使用特异性抑制剂ulixertinib对ERK1/2进行药理学抑制，对RAD21驱动的高转移能力表现出优越的抑制作用。利用LUAD患者标本进行的临床探索进一步验证了RAD21与ERK1/2-EMT过程之间的相关性。综上所述，我们的工作揭示了LUAD中RAD21介导的表观遗传调控与转移信号级联之间的调控关系。

乌利塞替尼在肺转移小鼠模型中良好的治疗效果，为在RAD21高表达肺腺癌中抑制ERK1/2提供了治疗依据。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。