FADS2介导Nrf2-SLC7A11轴激活通过谷氨酸外排促进乳腺导管原位癌进展
该数据集来自NCBI GEO,标题为FADS2介导Nrf2-SLC7A11轴激活通过谷氨酸外排促进乳腺导管原位癌进展,包含1个文件GSE292487_series_matrix.txt.gz,属于高通量测序表达谱数据,平台为GPL24676,物种为9606(人类)

基本信息
资源简介
FADS2介导Nrf2-SLC7A11轴激活通过谷氨酸外排促进乳腺导管原位癌进展
FADS2 Mediated Nrf2-SLC7A11 Axis Activation Promotes Breast Ductal Carcinoma in Situ Progression via Glutamate Efflux
该数据集来自NCBI GEO,标题为FADS2介导Nrf2-SLC7A11轴激活通过谷氨酸外排促进乳腺导管原位癌进展,包含1个文件GSE292487_series_matrix.txt.gz,属于高通量测序表达谱数据,平台为GPL24676,物种为9606(人类)。源站描述显示研究利用质谱成像刻画DCIS、同步IDC的DCIS及IDC病灶的小分子代谢谱,发现IDC中多不饱和脂肪酸积累显著高于DCIS(P<0.05),并与脂肪酸去饱和酶2表达上调一致。该数据可用于探索DCIS向IDC进展的代谢与表达特征(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Mar 20 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):阐明从导管原位癌(DCIS,浸润性导管癌(IDC)的非必然前驱病变)进展的机制仍是肿瘤学中的关键挑战。对具有差异侵袭性的病灶进行代谢谱分析可能有助于揭示DCIS进展背后的关键驱动因素。本研究采用质谱成像描绘DCIS、同步IDC的DCIS以及IDC病灶的小分子代谢谱。研究识别了驱动DCIS向IDC进展的关键代谢改变,包括肿瘤组织中脂肪酸生物合成升高。比较分析显示,IDC中多不饱和脂肪酸(PUFAs)的积累显著高于DCIS(P<0.05),这与免疫组化验证显示IDC中脂肪酸去饱和酶2表达上调一致。DCIS病灶主要积累磷脂酰肌醇 wit
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE292487
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 13 202,引用时请注意版本时效。
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pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
阐明导管原位癌(DCIS)——浸润性导管癌(IDC)的非必然前驱病变——的进展机制,仍是肿瘤学领域的一项关键挑战。对具有不同侵袭性的病变进行代谢谱分析,可能有助于揭示DCIS进展背后的关键驱动因素。本研究采用质谱成像技术,描绘了DCIS、伴同步IDC的DCIS以及IDC病变的小分子代谢谱。研究识别出驱动DCIS向IDC进展的关键代谢改变,包括肿瘤组织中脂肪酸生物合成的升高。比较分析显示,IDC中多不饱和脂肪酸(PUFAs)的蓄积显著高于DCIS(P<0.05),这与免疫组化验证显示的IDC中脂肪酸去饱和酶2表达上调相一致。DCIS病变主要蓄积含饱和/单不饱和酰基链的磷脂酰肌醇,而IDC则表现出含PUFA的磷脂酰肌醇的显著富集(P<0.01)。
此外,与DCIS相比,IDC中抗氧化分子(牛磺酸、抗坏血酸、谷胱甘肽)及解毒酶谷胱甘肽S-转移酶mu 2的水平显著降低(P<0.05),表明氧化还原稳态失调。引人注目的是,伴有同步IDC的DCIS显示出与IDC高度一致的代谢特征,提示其在恶性进展中充当过渡状态。这些发现表明,DCIS恶性进展表现出对PUFAs/磷脂酰肌醇的代谢依赖性,并伴随PUFA消耗和抗氧化剂耗竭。靶向PUFA生物合成或氧化还原稳态调节因子的治疗策略,可能为追踪和拦截DCIS进展提供新的转化研究途径。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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