GSE289216：NAE1介导的neddylation是效应CD8+ T细胞必需的翻译后修饰检查点

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE289216

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数据说明

CD8+ T细胞的最佳活化对于免疫介导的肿瘤杀伤至关重要，这一过程需要大量参与代谢、增殖和效应功能的蛋白质。尽管大量研究强调了转录调控在此过程中的作用，但配对的转录组与蛋白质组分析揭示，RNA谱与蛋白质水平的相关性较差。这一差异凸显了翻译后修饰（PTM）在活化过程中调控蛋白质丰度的重要性。然而，PTM对CD8+ T细胞蛋白质动态的影响仍未被充分探索。我们发现，neddylation——一种近期发现的PTM——在T细胞受体（TCR）刺激下被激活，并在结肠癌患者的效应CD8+ T细胞中富集。在机制上，我们发现neddylation的限速酶——神经前体细胞表达发育下调蛋白8激活酶E1（NAE1）——由NFATc1诱导，后者是TCR信号下游的关键转录因子。

我们的观察发现，NAE1的基因敲除显著扰乱了与激活和线粒体功能相关的蛋白质组景观。因此，缺乏NAE1的CD8+ T细胞表现出严重受损的激活、增殖和存活能力，并伴有线粒体功能受损。与此一致，CD8+ T细胞中NAE1的缺失消除了其抗肿瘤功能并促进了肿瘤进展。相反，NAE1的过表达显著改善了肿瘤浸润CD8+ T细胞的功能。总体而言，我们揭示了neddylation——一种此前未被充分重视的PTM——作为CD8+ T细胞激活的蛋白质组检查点。强制表达NAE1为增强抗肿瘤CD8+ T细胞反应提供了有前景的治疗潜力。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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