儿童与成人T细胞淋巴母细胞肿瘤SNP-array分析
数据基于Illumina Infinium全基因组基因分型（WGG）阵列，用于研究肿瘤样本中的基因拷贝数改变和等位基因特异性异常（如杂合性缺失LOH）
基本信息
资源简介
儿童与成人T细胞淋巴母细胞肿瘤SNP-array分析
SNP-array analysis in pediatric and adult T-cell lymphoblastic neoplasia
该数据集来自NCBI，标题为儿童与成人T细胞淋巴母细胞肿瘤的SNP-array分析，包含1个文件GSE288263_series_matrix.txt.gz，作者为Sarah Sandmann。数据基于Illumina Infinium全基因组基因分型（WGG）阵列，用于研究肿瘤样本中的基因拷贝数改变和等位基因特异性异常（如杂合性缺失LOH）。由于传统归一化方法主要针对二倍体正常样本，而癌症样本的基因组畸变可能干扰归一化与数据解读，该数据集可用于评估常规归一化方法在癌症样本中的效果，并支持肿瘤基因组变异分析（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Jan 28 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：Illumina Infinium全基因组基因分型（WGG）阵列正越来越多地应用于癌症基因组学，以研究基因拷贝数改变和等位基因特异性异常，如杂合性缺失（LOH）。为WGG阵列开发的归一化方法大多集中于二倍体正常样本。然而，对于癌症样本，基因组畸变可能会干扰归一化和数据解读。因此，我们检查了常规使用的Illumina Infinium阵列归一化方法应用于癌症样本时的效果。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：Genome variation profiling by SNP array、GPL25201、9606。本站分类：肿瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE288263
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jun 30 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
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- OpenDataLab:
数据说明
Illumina Infinium全基因组基因分型(WGG)芯片在癌症基因组学中越来越多地应用于研究基因拷贝数改变和等位基因特异性异常，如杂合性缺失(LOH)。针对WGG芯片归一化的方法大多集中于二倍体正常样本。然而，对于癌症样本，基因组异常可能会干扰归一化和数据解读。因此，我们检查了传统上用于Illumina Infinium芯片的归一化方法应用于癌症样本时的效果。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
