CRISPRi敲低KAT2A后CRC1和CRC2患者来源结直肠癌3D模型的转录组变化
该数据集来自NCBI GEO，包含CRISPRi敲低组蛋白乙酰转移酶KAT2A后，患者来源结直肠癌3D球状体CRC1和CRC2的转录组表达谱数据，采用高通量测序平台GPL21697，物种为人（9606）
基本信息
资源简介
CRISPRi敲低KAT2A后CRC1和CRC2患者来源结直肠癌3D模型的转录组变化
Transcriptomic changes in CRC1 and CRC2 patient-derived CRC 3D models after CRISPRi-based KAT2A knockdown
该数据集来自NCBI GEO，包含CRISPRi敲低组蛋白乙酰转移酶KAT2A后，患者来源结直肠癌3D球状体CRC1和CRC2的转录组表达谱数据，采用高通量测序平台GPL21697，物种为人（9606）。数据以1个series matrix文件提供，可用于分析KAT2A缺失引起的全局基因表达改变，支持结直肠癌中KAT2A功能及转录调控相关研究（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Jan 22 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：我们关注人结直肠癌中组蛋白乙酰转移酶KAT2A耗竭后的转录变化。因此，我们利用患者来源的结直肠癌3D球状体CRC1和CRC2作为模型，分析了基因表达的全局改变。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL21697、9606。本站分类：肿瘤/其他。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE287741
【使用注意】
· 源站最后修改于 Mar 29 202，引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们关注的是在人类结直肠癌中去除组蛋白乙酰转移酶KAT2A后的转录变化。因此，我们利用患者来源的结直肠癌3D球状体CRC1和CRC2作为模型，并分析了基因表达的全局改变。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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