CDX1和CDX2通过抑制β-catenin促进的Pol II-DSIF-PAF1C复合物形成抑制结肠癌干性

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE287500

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

同源盒转录因子CDX1和CDX2（以下称CDX1/2）在决定肠上皮细胞身份和调控其干细胞功能中发挥关键作用。然而，CDX1/2在调控结肠癌干性中的作用及其潜在机制尚不清楚。在此，我们表明，Cdx1的完全缺失或Cdx1/2的同时缺失增加了肠道肿瘤的干性和恶性程度。与此一致，CDX1/2降低了包括LGR5在内的癌症干性相关基因的表达水平。CDX1/2结合于LGR5转录起始位点（TSS）的下游区域，β-catenin亦结合于此。尽管H3乙酰化增加且染色质结构开放，CDX1/2仍降低了LGR5 TSS周围DRB敏感性诱导因子（DSIF）、RNA聚合酶II相关因子1（PAF1）及Pol II复合物的水平。CDX1/2通过同源域，以相加的方式阻止β-catenin与这些复合物之间的相互作用，从而协同抑制β-catenin促进的含DSIF和PAF1复合物的活性Pol II复合物的形成。

我们的研究结果表明，CDX1/2通过DSIF和PAF1复合物拮抗β-catenin，协同抑制结肠肿瘤发生和癌症干性。此外，DSIF和PAF1复合物作为转录平台，将肿瘤抑制信号和致癌信号整合到控制结肠肿瘤发生的基因表达中。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。