EFTX-G12V 在 SKCO1 细胞中脱靶效应表征

数据围绕首创新药 EGFR 导向的 KRAS G12V 选择性抑制剂 EFTX-G12V 的脱靶效应展开,可用于评估该抑制剂对基因表达的影响、分析其选择性及潜在脱靶作用,属于肿瘤相关研究(来源 NCBI)

geo
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基因组分类GPL301739606
GSE278020: Characterization of off-target effects of a first-in-class EGFR-directed KRAS G12V selective inhibitor, EFTX-G12V, in SKCO1 cells.

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

EFTX-G12V 在 SKCO1 细胞中脱靶效应表征

Characterization of off-target effects of a first-in-class EGFR-directed KRAS G12V selective inhibitor, EFTX-G12V, in SKCO1 cells.

该数据集来自 NCBI GEO,标题为 EFTX-G12V 在 SKCO1 细胞中脱靶效应表征,包含 1 个文件 GSE278020_series_matrix.txt.gz,采用高通量测序表达谱平台 GPL30173,物种为人(9606)。数据围绕首创新药 EGFR 导向的 KRAS G12V 选择性抑制剂 EFTX-G12V 的脱靶效应展开,可用于评估该抑制剂对基因表达的影响、分析其选择性及潜在脱靶作用,属于肿瘤相关研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Sep 25 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):尽管 KRAS-G12V 是癌症中第二常见的 KRAS 突变,但目前尚无获批的直接靶向 KRAS-G12V 抑制剂。使用传统方法抑制癌基因的困难促使人们将 RNAi 作为治疗手段。RNAi 作为癌症治疗面临诸多障碍,包括缺乏癌症特异性组织靶向、寡核苷酸被核酸酶快速降解以及从循环中被清除。最近,将可靶向配体与化学修饰的 siRNA 偶联已在规避这些障碍方面显示出显著前景。我们证明 EFTX-G12V 对 KRAS-G12V 具有高度选择性,并且比泛 KRAS 靶向具有更好的治疗活性,包括增强对若干癌症标志的抑制。借助一种新型 RNAi 递送平台,我们证明可在肿瘤中沉默 KRAS-G12V,并在多个……中表现出显著抗肿瘤活性

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL30173、9606。本站分类:肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE278020

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jul 16 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

尽管KRAS-G12V是癌症中第二常见的KRAS突变,但目前尚无获批的直接针对KRAS-G12V的抑制剂。使用传统方法抑制致癌基因的困难促使人们将RNAi作为一种治疗手段。RNAi作为癌症治疗手段面临诸多障碍,包括缺乏癌症特异性组织靶向性、寡核苷酸易被核酸酶快速降解以及从循环中被清除。近年来,将可靶向配体与化学修饰的siRNA偶联已在克服这些障碍方面展现出显著前景。我们证明EFTX-G12V对KRAS-G12V具有高度选择性,并且相较于泛KRAS靶向具有更好的治疗活性,包括对若干癌症标志性特征的增强抑制。借助一种新型RNAi递送平台,我们展示了在多种癌症模型中对KRAS-G12V的肿瘤沉默以及显著的抗肿瘤活性。我们的发现代表了利用RNAi进行致癌基因靶向的技术进步,并揭示了KRAS靶向的新生物学见解,这可能对安全性和有效性具有广泛意义。该数据集收集了SKCO1细胞系的RNA-Seq数据。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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