骨髓细胞驱动的快速肿瘤坏死定义骨肉瘤中STING激动剂治疗反应 [RNA-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE275335

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数据说明

骨肉瘤及许多其他肉瘤的特征是免疫抑制性、富含巨噬细胞的肿瘤微环境（TME），这一特征使得这些癌症通常对免疫治疗无反应。因此，需要新的策略来重编程TME。重新激活免疫系统的一种方法是激活cGAS-STING通路。然而，cGAS-STING通路在骨肉瘤中的状态以及激活该通路的后果大多未知。因此，我们在侵袭性疾病的人类骨肉瘤模型中分析了cGAS和STING，观察到该通路几乎普遍受到抑制。然而，STING激活基因特征可预测新诊断骨肉瘤患者的生存，提示克服STING抑制可能改善预后。在机制上，我们利用流式细胞术和scRNAseq证明，骨肉瘤中的STING激动剂引发由单核/巨噬细胞炎症反应启动的快速急性坏死级联反应，随后是持续的适应性反应和持久的T细胞介导的免疫记忆。

总体而言，我们的研究为涉及STING激动剂的骨肉瘤免疫治疗策略提供了机制基础，并确定预先存在的髓系细胞浸润可作为预测治疗反应的生物标志物。这些研究可能与其他具有髓系富集肿瘤微环境的间充质肿瘤相关。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。