Barrett食管与食管癌游离转录组数据[纳米孔长读长]
该数据集为Barrett食管（BE）、食管腺癌（EAD）及健康人血浆游离RNA测序数据，包含纳米孔长读长数据，共1个文件（GSE271389_series_matrix.txt.gz）
![GSE271389: Cell-free transcriptome of Barrett’s Esophagus and Esophageal Cancer [Nanopore - long read]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/195741.jpg)
基本信息
资源简介
Barrett食管与食管癌游离转录组数据[纳米孔长读长]
Cell-free transcriptome of Barrett’s Esophagus and Esophageal Cancer [Nanopore - long read]
该数据集为Barrett食管（BE）、食管腺癌（EAD）及健康人血浆游离RNA测序数据，包含纳米孔长读长数据，共1个文件（GSE271389_series_matrix.txt.gz）。源站描述指出EAD早期发现可显著提高五年生存率，而BE患者EAD风险更高却缺乏常规筛查，游离RNA测序有望成为微创诊断手段。该数据可用于生物标志物发现及BE、EAD与健康样本的分类研究（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Jul 03 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：食管腺癌（EAD）若在早期发现，五年生存率可大幅提高，因此早期检测策略对减轻疾病负担至关重要。被诊断为Barrett食管（BE）的患者患EAD的风险更高，但目前尚无针对EAD的常规筛查。游离RNA测序的最新进展旨在创建微创诊断方法。我们提供来自BE、EAD和健康患者血浆的短读长和长读长数据，用于生物标志物发现。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL26167、9606。本站分类：肿瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE271389
【使用注意】
· 源站最后修改于 Dec 08 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE271389
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
食管腺癌（EAD）若在早期阶段被检出，其五年生存率可获得大幅改善，因此早期检测策略对于减轻疾病负担至关重要。被诊断为巴雷特食管（BE）的患者罹患EAD的风险更高，但目前尚无针对EAD的常规筛查。近年来游离RNA测序技术的进展旨在创建微创诊断方法。我们展示了来自BE、EAD和健康患者血浆的短读长和长读长数据，用于生物标志物的发现。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
