经典上皮状态驱动胰腺癌对KRAS抑制的急性耐药

该数据集来自NCBI GEO,标题为经典上皮状态驱动胰腺癌对KRAS抑制的急性耐药,包含1个文件GSE271300_series_matrix.txt.gz,属于高通量测序表达谱数据,物种为人类(9606),平台为GPL20301

geo
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基因组分类GPL203019606
GSE271300: A classical epithelial state drives acute resistance to KRAS inhibition in pancreas cancer

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

经典上皮状态驱动胰腺癌对KRAS抑制的急性耐药

A classical epithelial state drives acute resistance to KRAS inhibition in pancreas cancer

该数据集来自NCBI GEO,标题为经典上皮状态驱动胰腺癌对KRAS抑制的急性耐药,包含1个文件GSE271300_series_matrix.txt.gz,属于高通量测序表达谱数据,物种为人类(9606),平台为GPL20301。源站描述指出研究利用基因工程小鼠模型和患者来源异种移植,发现基底型PDAC细胞对KRAS抑制剂高度敏感,并通过荧光和生物发光报告系统纵向追踪细胞状态动态,揭示KRAS抑制剂诱导经典状态快速富集,谱系追踪表明这些富集的经典PDAC细胞是疾病复发的储库。该数据可用于研究胰腺导管腺癌中基底与经典上皮状态的平衡、KRAS抑制剂耐药机制及复发相关细胞状态(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jul 02 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):胰腺导管腺癌(PDAC)的瘤内异质性以基底型和经典上皮癌细胞状态之间的平衡为特征,基底型优势与化疗耐药和不良预后相关。靶向胰腺癌的主要驱动因素致癌KRAS在临床试验中显示出早期希望,但疗效受到获得性耐药的限制。利用基因工程小鼠模型和患者来源异种移植,我们发现基底型PDAC细胞对KRAS抑制剂高度敏感。采用荧光和生物发光报告系统,我们在体内纵向追踪细胞状态动态,并揭示KRAS抑制剂诱导的经典状态快速富集。谱系追踪将这些富集的经典PDAC细胞鉴定为疾病复发的储库。经典细胞状态的基因消融与KRAS具有协同作用

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL20301、9606。本站分类:肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE271300

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jul 08 202,引用时请注意版本时效。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE271300

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

胰腺导管腺癌(PDAC)的瘤内异质性以基底样和经典型上皮癌细胞状态之间的平衡为特征,其中基底样优势与化疗耐药和不良预后相关。靶向胰腺癌的主要驱动因素——致癌性KRAS,在临床试验中显示出初步前景,但其疗效因获得性耐药而受限。利用基因工程小鼠模型和患者来源异种移植瘤,我们发现基底样PDAC细胞对KRAS抑制剂高度敏感。采用荧光和生物发光报告系统,我们在体内纵向追踪细胞状态动态,并揭示KRAS抑制剂可快速诱导经典型状态的富集。谱系追踪鉴定这些富集的经典型PDAC细胞是疾病复发的储库。经典型细胞状态的基因消融与KRAS抑制具有协同作用,为该治疗策略提供了临床前概念验证。我们的发现支持将经典型状态导向疗法与KRAS抑制剂联合应用,以加深缓解并抵消胰腺癌的耐药性。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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