GSE268689：具核梭杆菌驱动的线粒体自噬促进巨噬细胞内共生并推动食管鳞状细胞癌转移

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE268689

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数据说明

兼性胞内细菌具核梭杆菌（Fusobacterium nucleatum，Fn）介导食管鳞状细胞癌（ESCC）的肿瘤发生与进展。Fn的胞内生存策略、Fn能否通过细胞间接触在瘤内组织中播散，以及若存在此种播散，其潜在机制与意义目前尚不清楚。在此，我们观察到Fn在ESCC肿瘤及癌旁正常组织的巨噬细胞中蓄积。我们进一步发现，Fn通过不依赖PINK1-Parkin的途径诱导巨噬细胞线粒体自噬，减少过量线粒体ROS产生以促进存活。此外，Fn驱动巨噬细胞在糖酵解与氧化磷酸化之间发生双相代谢转换，以满足生存的生物能量需求。值得注意的是，Fn由巨噬细胞携带并递送至肿瘤，在ESCC中通过CCL2-CCR2轴促进肿瘤转移。使用线粒体分裂抑制剂（mdivi-1）处理可降低胞内Fn浓度，并抑制小鼠中Fn阳性肿瘤转移。

这些发现表明，线粒体自噬抑制剂或靶向线粒体自噬机制可能成为治疗Fn阳性肿瘤的有效治疗策略。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。