基于系统转录组分析鉴定白星花金龟幼虫在IL-1β诱导软骨肉瘤细胞中的抗炎作用

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE268400

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数据说明

骨关节炎（OA）是一种复杂的退行性关节疾病，也是一种多因素疾病。由于OA治疗困难，开发可用于理解其分子机制的新靶向策略至关重要。白星花金龟幼虫具有较高的治疗价值；然而，多种活性化合物的存在以及OA的多因素风险因素使得其精确作用机制尚不明确。我们通过系统性转录组分析筛选了白星花金龟幼虫水提取物（PBSL）及其化合物的关键作用机制。通过分析经PBSL处理的白细胞介素（IL）-1β诱导的人软骨肉瘤细胞（SW1353）的基因表达变化谱，分析了PBSL的主要机制和转录因子。此外，进行了体外实验以验证PBSL新机制和靶点的有效性。PBSL通过调控多种分子通路对SW1353细胞发挥抗炎作用。IL-6/JAK/STAT3通路被PBSL显著下调，STAT3被鉴定为调控PBSL诱导的靶基因表达的主要转录因子。

此外，我们发现六种PBSL化合物中，主要化合物受IL-6/JAK/STAT3通路调控。我们的研究结果进一步证实了抑制IL-6/JAK/STAT3通路是治疗OA的治疗靶点这一观点，为PBSL及其活性化合物对抗OA提供了潜在的新机制和转录因子。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。