GSE263689:衰老通过激活整合应激反应促进转移
该数据集为 GSE263689,标题为“衰老通过激活整合应激反应促进转移”,属于肿瘤/其他分类,来源于 ncbi.nlm.nih.gov

基本信息
资源简介
GSE263689:衰老通过激活整合应激反应促进转移
GSE263689 是一个公开的基因表达数据集,英文标题为“Ageing promotes metastasis via activation of the integrated stress response”,中文可译为“衰老通过激活整合应激反应促进转移”。该数据集归属于肿瘤/其他分类,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。其源站描述指出,这是一个 SuperSeries,由下方列出的若干 SubSeries 组成。数据集包含 1 个文件,样例文件名为 GSE263689_series_matrix.txt.gz。作者为 Volkan,Sayin,发布时间为 Apr 10 202。主题标签涉及高通量测序表达谱分析,并标注了 GPL17021 与 10090 等相关平台或物种标识。整体而言,该数据集围绕衰老与肿瘤转移之间的机制展开,重点指向整合应激反应的激活,适合关注肿瘤生物学、衰老相关转移机制以及高通量表达谱分析的研究人员参考使用。
【数据集背景】
该数据集标题明确指向一个生物学命题:衰老通过激活整合应激反应促进转移。从分类看,它被归入肿瘤/其他,说明其研究语境与肿瘤发生、发展或转移相关。来源站描述仅说明这是一个 SuperSeries,由下方列出的 SubSeries 组成,并未展开具体的实验设计、样本分组或干预条件。作者信息为 Volkan,Sayin,发布时间为 Apr 10 202。主题标签中的“Expression profiling by high throughput sequencing”表明其数据获取方式属于高通量测序表达谱分析,而 GPL17021 与 10090 则提供了平台与物种层面的标识线索。整体背景聚焦于衰老、整合应激反应与转移三者之间的关联,但更细的机制假设、实验模型和验证策略,源站未提供。
【数据内容】
该数据集的文件数量为 1,文件样例为 GSE263689_series_matrix.txt.gz。从文件形态看,这是一个 GZIP 压缩包,内部应为 series matrix 文本文件,通常用于承载表达谱矩阵及样本注释信息。主题标签中的高通量测序表达谱分析提示,数据内容可能涉及基因或转录本水平的表达定量结果,但具体包含哪些基因、多少样本、多少特征以及是否存在分组对比,源站未提供。由于该数据集被描述为 SuperSeries,其内容可能整合了多个 SubSeries 的数据,但 SubSeries 的具体构成、各自的数据类型与样本量,源站未提供。文件样例仅给出一个压缩包名称,未说明其内部是否还包含其他辅助文件或元数据表。
【采集与来源】
数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于公共数据库来源。作者为 Volkan,Sayin,发布时间为 Apr 10 202。主题标签中出现了 GPL17021 和 10090,前者通常对应基因表达检测平台,后者通常对应物种标识,但具体平台名称、物种名称以及样本采集的组织、时间点、处理条件等,源站未提供。源站描述仅说明该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,未给出各 SubSeries 的标题、编号或采集细节。因此,关于样本如何采集、实验如何设计、测序如何开展等信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肿瘤/其他分类下的表达谱分析场景,尤其适合关注衰老与转移关系、整合应激反应激活机制的研究。由于主题标签指向高通量测序表达谱,它可用于转录水平上的差异表达探索、通路富集分析或候选基因筛选等通用分析流程。对于希望复现或二次利用该 SuperSeries 的研究者,可将其作为表达矩阵来源,结合样本注释开展分组比较。但具体适用场景受限于数据实际内容,例如样本类型、分组设计和测序深度等,源站未提供,因此无法进一步明确其可支持的特定分析类型或结论范围。
【使用方法】
使用该数据集时,可先下载数据文件 GSE263689_series_matrix.txt.gz。由于文件为 GZIP 压缩包,应按 GZIP 格式进行读取和解压。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入。具体而言,可先解压并查看 series matrix 文件的表头、样本列和特征行,确认表达值格式、缺失值表示和注释信息是否符合预期。若后续分析涉及分组比较,需结合样本注释信息进行整理。由于该数据集为 SuperSeries,若需追溯具体子集,应进一步查看其 SubSeries 信息,但 SubSeries 的具体获取方式与内容,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集的文件数量为 1,文件样例为 GSE263689_series_matrix.txt.gz,未提供其他质控文件或原始测序数据。源站描述仅说明其为 SuperSeries,由下方列出的 SubSeries 组成,未提供样本量、测序深度、重复数、批次信息或质控指标。主题标签中的 GPL17021 与 10090 提供了平台与物种线索,但具体平台版本、物种名称及注释完整度,源站未提供。因此,无法对该数据集的完整性、一致性和偏差风险做出具体判断。使用者在接入前应自行核对字段与编码,并在小样本上验证读取流程,以降低因格式或注释问题导致的分析误差。
【引用与许可】
该数据集的作者为 Volkan,Sayin,发布时间为 Apr 10 202。来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的引用格式、许可条款、使用限制或版权声明,源站未提供。使用者在发表或二次分发前,应自行查阅来源站的相关政策与作者声明,确认引用要求和许可条件。由于源站未提供具体许可信息,无法在此给出明确的授权范围或使用限制说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE263689
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




