HDAC抑制剂通过FSP1的m6A修饰使结直肠癌对铁死亡敏感

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE263463

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

铁死亡疗法已在多种癌症中得到充分确立；然而，结直肠癌（CRC）对铁死亡具有高度耐药性，这阻碍了铁死亡疗法在CRC中的应用。通过药物筛选，我们发现组蛋白去乙酰化酶抑制剂（HDACi）显著增敏铁死亡。在机制上，HDACi通过促进FSP1 mRNA降解来降低FSP1水平，FSP1是一种已知的铁死亡防御分子。在进一步研究中，我们证实HDACi特异性靶向HDAC1，并抑制FTO和ALKBH5的H3K27ac修饰。FTO和ALKBH5的激活导致FSP1 mRNA上的N6-甲基腺苷（m6A）修饰减少，从而促使其降解，最终使CRC对铁死亡敏感。HDACi与铁死亡诱导剂的联合在体内和体外均协同减少CRC。总之，我们的研究揭示了HDACi如何增敏铁死亡，并提示HDACi/铁死亡诱导剂联合作为一种有前景的实体瘤治疗策略。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。