ARID1A IDR靶向EWS-FLI1凝聚体并精细调控有效染色质重塑

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE263234

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

嵌合转录因子EWS-FLI1发生液-液相分离（LLPS），并结合新形态微卫星DNA区域，进而招募cBAF以激活尤文肉瘤中的致癌转录程序。为鉴定参与该相互作用的cBAF特定亚基，我们采用无偏TurboID分析，揭示ARID1A为潜在介导因子。我们发现ARID1A的一个内在无序区（称为IDR1）发生同型相分离并融入EWS-FLI1液滴。该发现提示IDR1直接参与将cBAF招募至相分离的EWS-FLI1。此外，我们意外发现IDR1在调控cBAF有效染色质重塑活性中的功能。ARID1A IDR1双重作用的新发现为开发相关肿瘤的有效治疗策略开辟了途径。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。