GSE262873：microRNA调控的转录状态定义对免疫治疗有应答的瘤内CD8+T细胞

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE262873

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

晚期结直肠癌（CRC）发病率不断上升且生存率低，亟需有效的治疗选择。免疫检查点抑制（ICI），特别是抗PD-1治疗，显示出潜力，但预测阳性反应的临床决定因素尚不理想。在此，我们通过对肿瘤抗原特异性CD8 T细胞相关miRNA进行无偏倚的体内Crispr-Cas9筛选，鉴定出microRNA-155（miR-155）是CD8 T细胞浸润肿瘤所必需的。MiR-155对于关键的CD8 T细胞分化级联反应是必需的，其通过抑制Ship-1，从而抑制干性和Tcf-1，同时增强效应功能和Cxcr6表达，而后者是抗肿瘤和抗PD-1反应不可或缺的方面。通过miR-155依赖的CD8 T细胞转录谱，我们鉴定出一个基因特征，可预测十种癌症中的抗PD-1反应。综上所述，我们的发现支持这样一个模型：miR-155作为CD8 T细胞依赖性免疫在CRC中的核心轴，以及针对多种癌症的抗PD-1反应的核心轴，可被用于治疗或作为生物标志物。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。