PM2.5诱导五种人体系统疾病类型与致病机制的组学及人类疾病数据库研究 [EA.hy926]

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE252420

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数据说明

PM2.5可危害人体多个系统。然而，由于流行病学和毒理学的局限性，PM2.5在人体各系统中诱导的疾病类型、共有及特异性致病机制尚未得到全面深入的揭示。因此，本研究针对上述问题，在呼吸系统、循环系统、内分泌系统、女性泌尿生殖系统和男性泌尿生殖系统中进行了分析。根据本研究，PM2.5在上述各系统中分别更可能诱导肺气肿、再灌注损伤、甲状腺恶性肿瘤、卵巢子宫内膜异位症和肾炎。FOS、细胞外基质、泌尿生殖系统发育、赋予抗张强度的细胞外基质结构成分以及铁死亡是PM2.5在五个系统中最重要的共存基因、细胞组分、生物学过程、分子功能和通路。此外，BTG2、BIRC5、NFE2L2、TBK1和STAT1分别在各系统中是PM2.5显著特异性靶向的基因。

重要的疾病相关细胞组分、生物学过程和分子功能被PM2.5高度特异性地诱导，例如对创伤的反应、血管形态发生、体形态发生、内质网应激反应的负调控以及对I型干扰素的反应，分别是各系统中排名第一的独特存在的生物学过程。PM2.5高度特异性地作用于关键疾病相关通路，例如癌症中的PD-L1表达和PD-1检查点通路（呼吸系统）、细胞周期（循环系统）、细胞凋亡（内分泌系统）、抗原加工与呈递（女性）以及神经活性配体-受体相互作用（男性）。本研究提供了一种新的分析方法来阐明PM2.5相关疾病类型，这是对流行病学调查的重要补充。此外，本研究阐明了PM2.5暴露的风险，阐明了致病机制，并为促进pr提供了科学支持。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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