靶向SIRT1–HIF-2α轴解耦软骨肉瘤NAD+代谢依赖

源站描述围绕软骨肉瘤细胞对NAD+耗竭的脆弱性,涉及SIRT1通过HIF-2α介导的转录重编程强化NAD+代谢依赖,SIRT1敲低可消除小鼠原位移植瘤的侵袭表型,以及SIRT1抑制联合化疗促进凋亡并抑制肿瘤进展

geo
浏览 2
基因组分类GPL167919606
GSE248490: Decoupling NAD+ metabolic dependency in chondrosarcoma by targeting the SIRT1–HIF-2α axis

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-25

资源简介

靶向SIRT1–HIF-2α轴解耦软骨肉瘤NAD+代谢依赖

Decoupling NAD+ metabolic dependency in chondrosarcoma by targeting the SIRT1–HIF-2α axis

该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件GSE248490_series_matrix.txt.gz,主题为高通量测序表达谱分析,物种为人类(9606),平台为GPL16791。源站描述围绕软骨肉瘤细胞对NAD+耗竭的脆弱性,涉及SIRT1通过HIF-2α介导的转录重编程强化NAD+代谢依赖,SIRT1敲低可消除小鼠原位移植瘤的侵袭表型,以及SIRT1抑制联合化疗促进凋亡并抑制肿瘤进展。数据可用于研究软骨肉瘤NAD+代谢依赖、SIRT1–HIF-2α轴相关表达模式及高风险患者聚类分析(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Nov 22 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):软骨肉瘤是第二常见的原发性骨恶性肿瘤。尽管软骨肉瘤细胞对烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD+)耗竭具有脆弱性,但靶向NAD+合成通路仍具挑战性,因其在生物过程中具有广泛影响。在此,我们确立SIRT1作为核心介导因子,通过HIF-2α介导的转录重编程强化软骨肉瘤细胞对NAD+代谢的依赖。SIRT1敲低可消除小鼠原位移植瘤中软骨肉瘤的侵袭性表型。软骨肉瘤细胞在葡萄糖饥饿下通过积累NAD+并随后激活SIRT1–HIF-2α轴而茁壮生长。通过SIRT1抑制解耦这一联系可释放凋亡,并与化疗协同抑制肿瘤进展。无监督聚类分析识别出高风险软骨肉瘤患者

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL16791、9606。本站分类:肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE248490

【使用注意】

· 源站最后修改于 Feb 14 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE248490

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

软骨肉瘤是第二常见的原发性骨恶性肿瘤。尽管软骨肉瘤细胞对烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD+)耗竭具有脆弱性,但由于NAD+合成通路在生物学过程中具有广泛影响,靶向该通路仍面临挑战。在本研究中,我们确立SIRT1作为核心介导因子,通过HIF-2α介导的转录重编程强化软骨肉瘤细胞对NAD+代谢的依赖性。敲低SIRT1可消除小鼠原位移植瘤中软骨肉瘤的侵袭性表型。软骨肉瘤细胞通过积累NAD+并随后激活SIRT1–HIF-2α轴,在葡萄糖饥饿条件下得以存活。通过抑制SIRT1解耦这一联系可触发细胞凋亡,并与化疗协同抑制肿瘤进展。无监督聚类分析识别出一个以NAD+生物合成基因上调为特征的高风险软骨肉瘤患者亚组。最后,无论细胞内NAD+积累的潜在通路如何,抑制SIRT1均可消除HIF-2α转录活性并使软骨肉瘤细胞对多柔比星诱导的细胞毒性敏感化。

我们提供系统级指南,以制定软骨肉瘤的治疗策略。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案