GSE248008:提升免疫细胞抗肿瘤适应性的代谢开关

数据可用于研究代谢开关如何增强免疫细胞对抗肿瘤的适应性,支持免疫代谢与肿瘤免疫方向的表达谱分析(来源 NCBI)。源站首次发布:Nov 16 202

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基因组分类GPL185739606
GSE248008: A metabolic switch that boosts immune cell fitness against cancer

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

GSE248008:提升免疫细胞抗肿瘤适应性的代谢开关

GSE248008 是一个与肿瘤免疫代谢相关的基因表达数据集,其英文全称为“A metabolic switch that boosts immune cell fitness against cancer”,中文可理解为“一种增强免疫细胞抗肿瘤适应性的代谢开关”。该数据集来源于 NCBI(美国国家生物技术信息中心),本站将其归类于“肿瘤 / 其他”方向。从整体定位来看,该数据集围绕代谢调控如何提升免疫细胞在肿瘤微环境中的适应能力这一核心问题展开,属于免疫代谢与肿瘤免疫交叉领域的表达谱研究资源。数据集以 SuperSeries 形式组织,源站描述指出其由若干 SubSeries 组成,当前可获取的文件为一个 GSE248008_series_matrix.txt.gz 压缩文件,适合用于转录组层面的表达谱分析。整体而言,该数据集为研究代谢开关与免疫细胞抗肿瘤功能之间的关系提供了可下载、可复用的表达数据基础。

【数据集背景】

该数据集的主题聚焦于“代谢开关”与“免疫细胞适应性”以及“对抗癌症”之间的关系。源站标题为“A metabolic switch that boosts immune cell fitness against cancer”,表明其研究背景涉及免疫细胞在肿瘤环境中的代谢状态改变,以及这种改变如何增强免疫细胞对抗肿瘤的能力。数据集由 NCBI 发布,作者为 Vyom、Shah,发布时间为 Nov 16 202。本站分类将其归入“肿瘤 / 其他”,说明其应用领域主要面向肿瘤相关研究,同时可能涉及免疫学与代谢生物学的交叉方向。主题标签中包含“Expression profiling by high throughput sequencing”,说明该数据集采用高通量测序进行表达谱分析,属于转录组水平的表达研究资源。

【数据内容】

该数据集以 SuperSeries 形式存在,源站描述为“This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.”,即该 SuperSeries 由下方列出的若干 SubSeries 组成。当前可获取的文件数量为 1,文件样例为 GSE248008_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包格式,通常用于存储基因表达矩阵及相关样本注释信息。主题标签还包含 GPL18573 与 9606,其中 9606 对应人类物种标识,GPL18573 为平台标识,表明数据基于特定高通量测序平台产生。整体数据内容围绕表达谱展开,可用于分析代谢开关相关条件下免疫细胞的基因表达变化。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,即 NCBI 官方网站。数据集英文名为 GSE248008,源站标题与英文名一致。作者信息为 Vyom、Shah,发布时间为 Nov 16 202。源站描述仅说明该 SuperSeries 由若干 SubSeries 组成,未提供更详细的样本采集地点、采集时间、实验条件或处理流程等信息。主题标签中的 GPL18573 与 9606 提供了平台与物种层面的来源线索,但具体的样本来源、组织类型、细胞类型及实验设计细节,源站未提供。

【适用场景】

根据侧写线索,该数据可用于研究代谢开关如何增强免疫细胞对抗肿瘤的适应性,支持免疫代谢与肿瘤免疫方向的表达谱分析。具体而言,研究人员可以利用该数据集探索免疫细胞在代谢调控条件下的基因表达特征,分析可能与抗肿瘤适应性相关的表达变化,或将其作为免疫代谢研究的参考数据。由于数据采用高通量测序表达谱形式,适用于转录组层面的差异表达分析、功能富集分析以及免疫相关通路的表达模式研究。该数据集尤其适合关注肿瘤免疫微环境中免疫细胞代谢状态的研究者使用。

【使用方法】

使用该数据集时,可先下载数据文件 GSE248008_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包格式,需按相应格式进行读取和解压。建议先在小样本上核对字段与编码,确认数据格式、样本注释与表达值编码无误后,再批量接入后续分析流程。由于当前仅提供一个文件样例,实际分析时需根据该文件内容确认样本数量、基因标识及分组信息。若需结合 SubSeries 进行更细粒度分析,需进一步获取源站列出的 SubSeries 数据,但当前可获取文件数量为 1,具体 SubSeries 内容源站未提供。

【质量与限制】

该数据集当前可获取的文件数量为 1,文件样例为 GSE248008_series_matrix.txt.gz,属于压缩格式。源站描述仅说明 SuperSeries 由若干 SubSeries 组成,未提供样本量、测序深度、重复数、质控指标或批次信息等质量相关细节。发布时间为 Nov 16 202,作者为 Vyom、Shah。主题标签提供了平台与物种信息,但未提供数据完整性、缺失值处理或标准化方法的说明。因此,在使用该数据集时,应自行核对数据字段与编码,并在小样本上验证后再进行批量分析。关于样本来源、实验条件、伦理审批及数据质量控制的具体信息,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 NCBI,源站标题为“A metabolic switch that boosts immune cell fitness against cancer”,作者为 Vyom、Shah,发布时间为 Nov 16 202。关于该数据集的引用方式、使用许可、版权声明及再分发条件,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时,应参考 NCBI 及原始来源的相关政策,并依据源站提供的引用信息进行规范引用。由于许可信息未在现有资料中明确,建议直接访问 NCBI 源站页面获取最新的引用与许可要求。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE248008

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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