靶向MAPK14的lobeline上调Slurp1介导的TAM替代激活抑制并延缓结直肠癌生长
该数据集来自NCBI GEO,包含GSE247841系列的单细胞转录组测序数据,针对MC38结肠癌异种移植小鼠模型中lobeline处理与PBS对照的肿瘤样本

基本信息
资源简介
靶向MAPK14的lobeline上调Slurp1介导的TAM替代激活抑制并延缓结直肠癌生长
Targeting MAPK14 by lobeline upregulates Slurp1-mediated inhibition of alternative activation of TAM and retards colorectal cancer growth
该数据集来自NCBI GEO,包含GSE247841系列的单细胞转录组测序数据,针对MC38结肠癌异种移植小鼠模型中lobeline处理与PBS对照的肿瘤样本。数据覆盖肿瘤免疫微环境中TAM极化状态及Slurp1表达变化,可用于分析lobeline调控TAM由M2样向M1样极化的转录组特征,以及Slurp1介导该过程的分子机制研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Nov 15 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):结直肠癌常产生免疫抑制微环境,使其对免疫治疗无响应,目前尚未找到有效的治疗选择。本研究中,基于观察到中药半边莲中的生物碱lobeline在MC38结肠癌异种移植小鼠模型中抑制肿瘤,我们对lobeline处理和PBS处理的小鼠肿瘤进行了单细胞转录组测序分析,发现lobeline促进TAM向M1样极化,同时抑制其向M2样极化。此外,lobeline上调了癌细胞中分泌型Ly-6/UPAR相关蛋白1(Slurp1)的mRNA水平。在Slurp1-/-小鼠或注射Slurp1敲低腺病毒的WT小鼠中,lobeline对肿瘤负荷的抑制作用和对TAM极化的调控消失,表明Slurp1介导lobeline调控的过程。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL19057、10090。本站分类:肿瘤/其他。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE247841
【使用注意】
· 源站最后修改于 Feb 14 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
结直肠癌常形成免疫抑制微环境,使其无法对免疫治疗产生应答。目前尚未找到有效的治疗方案。本研究基于以下观察:在MC38结肠癌异种移植小鼠模型中,中药半边莲中的生物碱山梗菜碱可抑制肿瘤生长。我们对山梗菜碱处理组和PBS处理组小鼠肿瘤进行了单细胞转录组测序分析,发现山梗菜碱促进肿瘤相关巨噬细胞(TAM)向M1样极化,同时抑制其向M2样极化。此外,山梗菜碱上调了癌细胞中分泌型Ly-6/UPAR相关蛋白1(Slurp1)的mRNA水平。在Slurp1-/-小鼠或注射Slurp1敲低腺病毒的野生型小鼠中,山梗菜碱对肿瘤负荷的抑制作用及对TAM极化的调控作用均消失,提示Slurp1介导了山梗菜碱调控TAM极化并抑制肿瘤进展的过程。通过靶标响应可及性分析(TRAP)、等温滴定量热法(ITC)和微量热泳动实验(MST),我们证实MAPK14是山梗菜碱的靶蛋白。
在机制层面,Lobeline与结肠癌细胞中的MAPK14结合后,阻止了MAPK14的核转位,从而降低了磷酸化p53的水平。随后,p53对Slurp1的负向转录调控受到抑制,促进了Slurp1的转录和分泌。此外,Lobeline与PD-1抗体的联合应用显示出更强的抗肿瘤效果。因此,这些发现表明,Lobeline介导的抗肿瘤免疫激活可能是一种有前景的结直肠癌治疗策略。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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