儿童及青少年MPNST与MPNST样病变DNA甲基化谱数据集

该数据集来自NCBI GEO,包含儿童及青少年恶性外周神经鞘瘤(MPNST)及MPNST样病变的DNA甲基化谱数据,基于基因组覆盖阵列检测,共1个文件

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基因组分类GPL211459606
GSE246644: Malignant peripheral nerve sheath tumor (MPNST) and MPNST-like entities defined by DNA methylation profile in pediatric and juvenile population

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-08

资源简介

儿童及青少年MPNST与MPNST样病变DNA甲基化谱数据集

Malignant peripheral nerve sheath tumor (MPNST) and MPNST-like entities defined by DNA methylation profile in pediatric and juvenile population

该数据集来自NCBI GEO,包含儿童及青少年恶性外周神经鞘瘤(MPNST)及MPNST样病变的DNA甲基化谱数据,基于基因组覆盖阵列检测,共1个文件。数据可用于评估DNA甲基化谱在儿童MPNST诊断中的价值,区分前分子时代的形态学模仿病变,并探索MPNST样“杂交”组的分子异质性(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Oct 31 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):恶性外周神经鞘瘤(MPNST)的诊断可能具有挑战性,但其特征性DNA甲基化谱(DMP)有助于诊断。最近识别出一个以保留H3K27me3表达为特征的MPNST样组。为评估DMP在儿童/青少年MPNST中的诊断实用性,我们从Bambino Gesù儿童医院DMP数据库中选取了儿童/青少年恶性肿瘤。DMP揭示了组织学上同质的MPNST/非典型神经纤维瘤中意想不到的分子异质性,而具有MPNST样DMP的样本则表现出组织学多样性。总之,DMP有助于诊断MPNST,区分前分子时代被归类为MPNST的形态学模仿病变,并研究儿童中MPNST样“杂交”组。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL21145、9606。本站分类:肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE246644

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jan 30 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

恶性外周神经鞘瘤(MPNSTs)的诊断可能具有挑战性,但其特征性的DNA甲基化谱(DMP)可提供辅助。近期识别出一个MPNST样群体,其特征为保留H3K27me3表达。为了评估DMP在儿童/青少年MPNSTs中的诊断价值,我们从Bambino Gesù儿童医院DMP数据库中选择了儿童/青少年恶性肿瘤。DMP揭示了组织学上同质的MPNSTs/非典型神经纤维瘤中意想不到的分子异质性,而具有MPNST样DMP的样本则表现出组织学多样性。总之,DMP有助于诊断MPNST,区分前分子时代被归类为MPNST的形态学模仿者,并研究儿科中的MPNST样“混合”群体。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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