BAF染色质重塑复合物药理抑制作为转录因子依赖型癌症治疗策略

该数据集来自NCBI GEO,标题为BAF染色质重塑复合物药理抑制作为转录因子依赖型癌症治疗策略,属于SuperSeries,由若干SubSeries组成

geo
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基因组分类GPL111549606
GSE241450: Pharmacologic inhibition of BAF chromatin remodeling complexes as a therapeutic approach to transcription factor-dependent cancers

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-30

资源简介

BAF染色质重塑复合物药理抑制作为转录因子依赖型癌症治疗策略

GSE241450 是一个来自 NCBI GEO 的基因表达数据集,英文标题为“Pharmacologic inhibition of BAF chromatin remodeling complexes as a therapeutic approach to transcription factor-dependent cancers”,中文可译为“BAF染色质重塑复合物的药理抑制作为转录因子依赖型癌症的治疗策略”。该数据集属于肿瘤领域的表达谱研究,采用高通量测序技术进行表达谱分析,物种为人(9606),平台编号为 GPL11154。数据集以 SuperSeries 形式组织,由若干 SubSeries 组成,当前可获取的文件为一个 GZIP 压缩的 series matrix 文件。该数据集面向转录因子依赖型癌症中 BAF 染色质重塑复合物药理抑制的相关研究,适合需要复用其表达谱数据进行二次分析或方法验证的研究者参考使用。

【数据集背景】

该数据集关注 BAF 染色质重塑复合物在转录因子依赖型癌症中的药理抑制策略。BAF 复合物是参与染色质结构调控的重要分子机器,其药理抑制被作为针对转录因子依赖型肿瘤的治疗思路提出。数据集标题直接反映了这一研究主题,源站标题与数据集英文名一致。数据集所属分类为肿瘤/其他,主题标签包含“Expression profiling by high throughput sequencing”,表明其核心数据类型为基于高通量测序的表达谱分析。数据集以 SuperSeries 形式发布,源站描述说明该 SuperSeries 由下列 SubSeries 组成,即其整体由若干子系列汇集而成,用于支撑同一研究主题下的表达谱数据组织。

【数据内容】

数据集当前提供的文件数量为 1,文件样例为 GSE241450_series_matrix.txt.gz,即一个经 GZIP 压缩的系列矩阵文本文件。该文件通常承载样本层面的表达谱矩阵信息,但具体包含的样本数量、基因或转录本条目数、分组设计、处理条件与对照设置等细节,源站未提供。主题标签中列出的 GPL11154 为平台编号,9606 为人物种编号,说明数据来自人类样本并在该平台上产生。由于数据集为 SuperSeries,其底层 SubSeries 的具体构成与各自数据内容,源站未提供进一步说明。

【采集与来源】

数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,即 NCBI GEO 数据库。作者信息记录为 Salih,Topal。发布时间记录为 Aug 22 202,该日期字段在源站信息中呈现为不完整形式,具体年份的完整写法源站未提供明确说明。数据产生所依托的实验材料、样本来源、处理方案、测序策略与建库细节,源站未提供。数据集以 SuperSeries 形式组织,其子系列的采集与来源信息亦未在现有描述中展开。

【适用场景】

该数据集适用于转录因子依赖型癌症中 BAF 染色质重塑复合物药理抑制相关的表达谱研究场景,可用于了解该研究主题下的高通量表达谱数据组织方式,并作为二次分析、方法比对或结果复现的候选数据资源。由于数据以系列矩阵文件形式提供,适合开展样本层面的表达模式汇总分析。具体的分析类型、可支持的统计比较以及是否适合特定癌症亚型的研究,需结合数据文件实际内容判断,源站未提供相应说明。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE241450_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式进行读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认文件结构、样本标识与表达值编码无误后,再批量接入后续分析流程。由于该数据集为 SuperSeries,若需追溯具体子系列的数据,应结合源站 SuperSeries 与 SubSeries 的组织关系进行定位,源站未提供子系列的详细清单。数据读取过程中应注意压缩文件的解压与文本解析,避免因编码或分隔符问题导致字段错位。

【质量与限制】

当前可获取的文件数量为 1,且为系列矩阵文件,数据内容的完整性与样本覆盖范围需以实际文件为准。数据集以 SuperSeries 形式发布,其子系列的具体构成、样本量、重复设置与质控信息,源站未提供。发布时间字段呈现为不完整形式,可能影响对数据时效性的准确判断。此外,数据集未提供明确的批次信息、归一化方法说明与缺失值处理说明,使用者在开展跨数据集比较或严格统计推断时应保持谨慎,并在分析前自行核查数据质量。

【引用与许可】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,作者记录为 Salih,Topal。使用该数据集时应遵循源站的相关使用条款与引用规范,具体引用格式、许可类型与使用限制,源站未提供。建议在使用前查阅 NCBI GEO 对应页面以获取最新的引用与许可信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE241450

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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