PDGFRβ信号与β-catenin协同调控c-Abl及硬纤维瘤生物学行为的微阵列数据集
该数据集来自NCBI,包含硬纤维瘤与正常间充质组织的微阵列表达谱数据,共1个文件(GSE237692_series_matrix.txt.gz)
![GSE237692: PDGFRβ signaling cooperates with β-catenin to modulate c-Abl and biologic behavior of desmoid-type fibromatosis [microarray]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/185747.jpg)
基本信息
资源简介
PDGFRβ信号与β-catenin协同调控c-Abl及硬纤维瘤生物学行为的微阵列数据集
PDGFRβ signaling cooperates with β-catenin to modulate c-Abl and biologic behavior of desmoid-type fibromatosis [microarray]
该数据集来自NCBI,包含硬纤维瘤与正常间充质组织的微阵列表达谱数据,共1个文件(GSE237692_series_matrix.txt.gz)。源站描述显示,研究利用HIF1活性相关基因对硬纤维瘤和正常间充质组织进行无监督聚类,能够准确区分肿瘤组织与正常对照。数据可用于探索PDGFRβ信号与β-catenin协同调控c-Abl及硬纤维瘤生物学行为的分子机制,并支持肿瘤与正常组织的分类建模(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jul 18 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):利用与HIF1活性相关的基因对硬纤维瘤和正常间充质组织进行无监督聚类。该方法准确地将肿瘤组织与正常对照区分开来。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL571、9606。本站分类:肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE237692
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jan 30 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE237692
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
使用与HIF1活性相关的基因对硬纤维瘤和正常间充质组织进行了无监督聚类分析。这一方法准确地将肿瘤组织与正常对照区分开来。本研究旨在识别硬纤维瘤型纤维瘤病相较于正常间充质组织差异表达的基因。我们注意到,在体外研究中,β-catenin——硬纤维瘤型纤维瘤病的核心驱动因子——似乎调控HIF1信号通路。随后,利用与HIF1及血管生成通路相关的基因对硬纤维瘤和正常间充质组织进行无监督聚类分析。这些基因能够准确区分肿瘤样本与正常样本。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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