A549细胞中ATF3与ZIKV依赖的转录组
该数据集为GSE233049,来源于ncbi.nlm.nih.gov,包含亲本或ATF3敲除的A549肺上皮腺癌细胞系在模拟感染或ZIKV感染后的转录组(polyA+ RNAseq)数据

基本信息
资源简介
A549细胞中ATF3与ZIKV依赖的转录组
ATF3- and ZIKV-dependent transcriptome of A549 cells
该数据集为GSE233049,来源于ncbi.nlm.nih.gov,包含亲本或ATF3敲除的A549肺上皮腺癌细胞系在模拟感染或ZIKV感染后的转录组(polyA+ RNAseq)数据。数据文件数量为1,样例文件为GSE233049_series_matrix.txt.gz,作者为Morgan和Sammons,发布时间为May 21 202。主题标签涉及表达谱分析、高通量测序、GPL21290和9606。该数据可用于研究ATF3与ZIKV感染对A549细胞转录组的影响,支持差异表达分析和相关预测任务(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:May 21 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):我们检测了亲本或ATF3敲除的A549肺上皮腺癌细胞系在模拟感染或ZIKV感染后的转录组(polyA+ RNAseq)。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL21290、9606。本站分类:肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE233049
【使用注意】
· 源站最后修改于 Dec 04 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE233049
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们检测了亲本或ATF3敲除的A549肺上皮腺癌细胞系在模拟感染或寨卡病毒感染后的转录组(polyA+ RNA测序)。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




