GSE229906：嵌合蛋白EWS::FLI1通过KCNN1/SK1异常表达和钙信号失调驱动尤文肉瘤细胞增殖

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE229906

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

尤文肉瘤（ES）的特征是存在EWS::FLI1或EWS::ERG融合蛋白。鉴于离子通道参与肿瘤发生，本研究旨在探讨编码SK1钾通道的KCNN1基因在ES发生发展中的作用。利用数据库进行生物信息学分析，研究KCNN1在患者和细胞系中的表达。采用分子方法和体外实验研究KCNN1的转录调控及其在ES细胞增殖调控中的作用。KCNN1在ES患者活检组织中过表达，其表达与患者生存率呈负相关。EWS::FLI1与EWS::ERG一样，可促进KCNN1和SK1的表达，并结合于KCNN1各亚型启动子附近的GGAA微卫星序列。KCNN1参与ES细胞增殖的调控，其沉默与细胞周期减慢相关，其表达可调节膜电位，进而影响钙流。

这些结果突出表明，KCNN1是EWS::FLI1和EWS::ERG的直接靶点，并证明KCNN1参与细胞内钙活性及ES细胞增殖的调控，使其成为ES中一个有前景的治疗靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。