信号肽酶复合体切割假蛋白酶iRhom2揭示内质网到细胞核信号通路

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE219008

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

iRhom是菱形样超家族中的假蛋白酶成员，是炎症和生长因子信号传导的主要调控因子；它们主要通过识别其底物的跨膜结构域来发挥作用。在此，我们报道了iRhom一种机制上截然不同的核功能，显示人和小鼠的iRhom2均是信号肽酶复合物（SPC）的非经典底物，SPC是切除分泌蛋白信号肽的蛋白酶。iRhom2的切割产生一个N端片段，该片段进入细胞核并改变转录组，部分通过结合C端结合蛋白（CtBPs）实现。核内iRhom2的生物学意义体现在：银屑病、伴食管癌的角化病（TOC）和非表皮松解性掌跖角化病（NEPPK）患者皮肤活检中其水平升高；银屑病角质形成细胞模型中iRhom2切割增加；以及核内iRhom2促进角质形成细胞增殖。总体而言，这项工作鉴定了一条意想不到的依赖SPC的内质网至细胞核信号通路，并证明iRhom可介导核信号传导。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。