卵巢高钙血症型小细胞癌COV434细胞系基因表达数据集
该数据集来自NCBI，包含卵巢高钙血症型小细胞癌（SCCOHT）细胞系COV434的基因表达数据。SCCOHT是一种罕见且侵袭性强的卵巢癌，常伴有SMARCA4（BRG1）失活突变
基本信息
资源简介
卵巢高钙血症型小细胞癌COV434细胞系基因表达数据集
Gene expression in small cell carcinoma of the ovary, hypercalcemic type (SCCOHT) cell line COV434
该数据集来自NCBI，包含卵巢高钙血症型小细胞癌（SCCOHT）细胞系COV434的基因表达数据。SCCOHT是一种罕见且侵袭性强的卵巢癌，常伴有SMARCA4（BRG1）失活突变。研究通过RNA-seq比较了SMARCA4重新表达前后的细胞系，旨在探究SMARCA4恢复如何影响基因表达和RNA剪接。数据可用于分析SMARCA4在SCCOHT肿瘤发生中的作用，以及相关表达和剪接变化（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Nov 10 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：卵巢高钙血症型小细胞癌（SCCOHT）是一种罕见且侵袭性强的卵巢癌。SCCOHT肿瘤具有SMARCA4（BRG1）的失活突变，SMARCA4是SWI/SNF染色质重塑复合物中两个互斥的ATP酶之一。为了探究SMARCA4缺失在SCCOHT肿瘤发生中的作用，我们在SCCOHT细胞系中进行了RNA-seq，比较了SMARCA4重新表达与否的情况。SMARCA4重新表达是通过整合pIND20-BRG1并用多西环素诱导实现的。本研究的目的是生成高测序深度的RNA-seq数据集，以确定SMARCA4的恢复如何导致基因表达和RNA剪接的变化。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL24676、9606。本站分类：肿瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE217699
【使用注意】
· 源站最后修改于 Apr 03 202，引用时请注意版本时效。
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数据说明
卵巢高钙血症型小细胞癌（SCCOHT）是一种罕见且侵袭性强的卵巢癌。SCCOHT肿瘤中存在SMARCA4（BRG1）的失活突变，SMARCA4是SWI/SNF染色质重塑复合物两个互斥ATP酶之一。为探讨SMARCA4缺失在SCCOHT肿瘤发生中的作用，我们在SCCOHT细胞系中对SMARCA4再表达与否进行了RNA-seq。SMARCA4再表达通过整合pIND20-BRG1并用多西环素诱导实现。本研究旨在生成高测序深度的RNA-seq数据集，以确定SMARCA4的恢复如何导致基因表达和RNA剪接的改变。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
