核内pCHK1作为ATR抑制敏感性升高的潜在生物标志物

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE217579

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

过度的基因组不稳定性加上DNA修复途径的异常，在癌细胞增殖时诱导高水平的“复制应激”。新的治疗策略并非阻碍癌细胞增殖，而是将注意力转向靶向DNA损伤应答和复制应激应答通路中的细胞周期检查点激酶（如ATR、CHK1、WEE1等），从而使未修复的DNA损伤得以延续至有丝分裂灾难和凋亡。ATR激酶选择性抑制剂elimusertib（BAY 1895344）已在临床前和临床中显示出单药活性；然而，仍缺乏可靠的治疗获益预测生物标志物。在本研究中，通过对来自不同癌症类型的24种细胞系以及一组卵巢癌细胞系进行基因表达谱分析，我们发现检查点激酶1（CHK1）的核内特异性富集与对elimusertib的敏感性增加相关。

在后续的细胞系来源异种移植标本中，我们采用先进的多光谱成像系统，发现核内磷酸化CHK1（pCHK1）染色与对ATR抑制剂elimusertib敏感性增加之间存在趋势，表明pCHK1表达作为ATR抑制剂敏感性预测生物标志物具有潜在价值。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。