整合单细胞多组学分析揭示HOX-PBX基因调控网络调控mTOR过度活跃细胞存活的snRNA-Seq数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE217107

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

淋巴管肌瘤病（LAM）是一种罕见且致衰的肺部疾病，主要影响育龄期女性。LAM细胞携带结节性硬化症复合物（TSC1/TSC2）基因的有害突变，导致雷帕霉素机制靶蛋白复合物1（mTORC1）过度活化，最终引起细胞生长失调。整合单细胞组学数据发现，肺LAMCORE细胞中子宫特异性HOX-PBX转录程序的激活。网络分析预测，包括PBX1和HOXD11在内的同源盒转录因子是控制LAMCORE细胞命运的关键调节因子。靶向HOX-PBX网络可能在LAM和TSC相关疾病中具有治疗价值，也可能在其他mTORC1过度活跃的肿瘤中具有治疗价值。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。