小鼠DCIS与浸润性导管乳腺癌表达谱
该数据集为小鼠DCIS与浸润性导管乳腺癌的表达谱数据，来源于NCBI，包含健康组织、DCIS及浸润性乳腺肿瘤样本，用于识别在DCIS和浸润性导管癌中表达增强的标志基因
基本信息
资源简介
小鼠DCIS与浸润性导管乳腺癌表达谱
GSE21444 是一个面向小鼠乳腺肿瘤研究的基因表达谱数据集，全称为 Expression profiling of murine DCIS and invasive ductal breast carcinoma，即小鼠导管原位癌（DCIS）与浸润性导管乳腺癌的表达谱分析。该数据集来源于 NCBI，收录于本站“肿瘤 / 其他”分类之下，核心目标是通过比较健康组织、导管原位癌组织与浸润性乳腺肿瘤组织的基因表达差异，识别在 DCIS 及浸润性导管癌中表达增强的标志基因。数据集以单个压缩的表达谱矩阵文件形式提供，适合从事乳腺肿瘤分子机制、肿瘤进展标志物筛选及小鼠模型表达谱分析的研究者参考使用。
【数据集背景】
乳腺肿瘤从导管原位癌向浸润性导管癌的进展过程涉及一系列基因表达层面的改变，识别在这一过程中表达增强的分子标志物，对于理解肿瘤侵袭机制和寻找潜在诊断靶点具有重要意义。该数据集以小鼠为研究对象，围绕健康组织、DCIS 与浸润性乳腺肿瘤三类样本开展表达谱分析，其设计意图正是服务于上述标志基因的识别工作。源站标题与描述均明确指向“小鼠 DCIS 与浸润性导管乳腺癌的表达谱”，说明该数据在肿瘤进展比较研究方面具有明确的定位。
【数据内容】
数据集包含 1 个文件，文件样例为 GSE21444_series_matrix.txt.gz，即 GZIP 压缩格式的表达谱矩阵文件。样本类型覆盖小鼠健康组织、导管原位癌组织以及浸润性乳腺肿瘤组织，构成从正常到原位癌再到浸润性癌的对照体系。主题标签显示该数据属于 Expression profiling by array（基于芯片的表达谱），涉及平台编号 GPL1261，物种编号为 10090（即小鼠）。矩阵文件通常承载样本信息与基因表达数值，便于研究者按样本分组开展差异表达比较。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，作者为 Céline、Schaefer，发布时间为 Apr 21 201。源站描述说明，研究对小鼠健康组织样本、DCIS 及浸润性乳腺肿瘤进行了分析，目的是识别在 DCIS 和浸润性导管癌中表达增强的标志基因。数据经 NCBI 平台对外提供，本站按“肿瘤 / 其他”分类进行收录与呈现。
【适用场景】
该数据集适用于小鼠乳腺肿瘤进展相关的表达谱研究，包括健康组织与 DCIS、DCIS 与浸润性导管癌之间的差异表达比较，以及候选标志基因的筛选与验证性分析。由于同时涵盖三类样本，也可用于构建从正常到原位癌再到浸润性癌的表达变化脉络，为后续实验研究提供线索。此外，基于芯片的表达谱数据亦可用于方法学层面的表达数据分析流程练习与对照参考。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE21444_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式进行读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认样本分组、基因标识与表达数值的组织方式无误后，再批量接入完整数据开展分析。分析时应依据样本类型区分健康组织、DCIS 与浸润性乳腺肿瘤三类分组，围绕表达增强的标志基因这一研究目标设计比较方案。
【质量与限制】
源站未提供关于样本量、芯片平台细节、数据预处理方法及质控指标的具体说明。该数据为小鼠模型来源的表达谱数据，其结果向人类乳腺癌的推广需谨慎对待。数据集仅含 1 个矩阵文件，未提供原始芯片文件等其他层级数据，使用者在复现或深入分析时可能受到一定限制。
【引用与许可】
源站未提供引用方式与许可条款的具体信息。使用该数据集时，建议注明其来源站 ncbi.nlm.nih.gov 及数据集编号 GSE21444，作者信息可参考 Céline、Schaefer。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE21444
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
分析了小鼠健康组织样本、导管原位癌（DCIS）和浸润性乳腺肿瘤，以识别在DCIS和浸润性导管癌中表达增强的标志基因。通过这种方法，我们能够鉴定出一组基因，这些基因未来可能有助于更好地检测DCIS和浸润性癌。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
