硫氧还蛋白1结合MALAT1减轻脑出血后炎症与凋亡数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE212595

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

转录后调控和RNA结合蛋白(RBPs)分别在大脑出血(ICH)发生及继发性损伤中发挥重要作用。因此，我们筛选了ICH后差异表达的RBPs，并发现硫氧还蛋白1(Txn1)是差异表达最显著的RBPs之一。我们还利用ICH模型和体外实验探究Txn1的作用，以阐明Txn1在ICH中的机制。首先，我们发现Txn1主要表达于中枢神经系统的小胶质细胞和神经元中，其蛋白水平在血肿周围组织中显著降低。此外，我们通过立体定向注射腺相关病毒(AAV)建立了Txn1过表达的ICH模型，并发现Txn1过表达可减轻ICH后的继发性损伤并改善预后。为进一步了解Txn1在ICH后的作用机制，RNA免疫沉淀结合高通量测序(RIP-seq)显示，Txn1与炎症和凋亡相关的mRNA结合，并通过RNA剪接和翻译起始影响RNA表达。

最后，RNA pull-down实验和体外实验证实，Txn1与转移相关肺腺癌转录本1（MALAT1）结合，从而减少炎症和细胞凋亡。综上所述，我们的结果表明，Txn1通过影响MALAT1的转录后调控来减轻ICH诱导的脑损伤。因此，Txn1可能成为缓解ICH诱导脑损伤的潜在治疗靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。