HCAR1核定位驱动肿瘤恶性进展的RNA-seq数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE210469

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

G蛋白偶联受体（GPCR）的定位偏倚参与多种细胞功能及其在病理状态下的失调，仍是一个尚未充分探索的领域。HCAR1是一种乳酸GPCR，主要因Warburg效应而与癌症进展相关，但其作用机制仍不明确。在此，我们证明HCAR1具有核定位，能够在核内进行信号传导，诱导核内ERK和AKT磷酸化，同时伴随更高的癌细胞增殖和存活。我们确定了其核内相互作用组，证明其参与蛋白质翻译和DNA损伤修复。核内HCAR1（N-HCAR1）直接与染色质/DNA相互作用，促进参与细胞迁移的基因表达。值得注意的是，我们显示N-HCAR1所调控的转录组特征范围比其质膜（PM）对应物更为广泛，这强调了N-HCAR1的功能输出大于PM定位的HCAR1。我们的研究揭示了若干前所未有的过程，说明GPCR如何通过定位偏倚活性调控多种细胞功能，以及癌细胞如何利用这些过程。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。