恶病质血液肿瘤小鼠炎性单核细胞基因表达谱(bulk RNA-seq)
数据聚焦晚期癌症相关恶病质中出现的类中性粒细胞单核细胞亚群(CiMs),可用于分析IL36G阳性CD38+ CiMs在慢性单核细胞血液肿瘤及恶病质进展中的转录组特征,并支持与多小鼠模型及晚期实体瘤患者数据的比较研究(来源 NCBI)
![GSE210001: Gene expression profile of inflammatory monocytes in cachectic blood cancer mice [bulk RNA-seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/175500.jpg)
基本信息
资源简介
恶病质血液肿瘤小鼠炎性单核细胞基因表达谱(bulk RNA-seq)
Gene expression profile of inflammatory monocytes in cachectic blood cancer mice [bulk RNA-seq]
该数据集为GSE210001,来源于NCBI GEO,包含恶病质血液肿瘤小鼠炎性单核细胞的bulk RNA-seq基因表达谱,共1个文件(GSE210001_series_matrix.txt.gz)。数据聚焦晚期癌症相关恶病质中出现的类中性粒细胞单核细胞亚群(CiMs),可用于分析IL36G阳性CD38+ CiMs在慢性单核细胞血液肿瘤及恶病质进展中的转录组特征,并支持与多小鼠模型及晚期实体瘤患者数据的比较研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jul 28 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):许多晚期癌症患者会发展为恶病质。尽管其患病率高且对生活质量和生存有灾难性影响,但导致癌症恶病质发展的关键病理生物学介质仍不清楚。在此,我们展示了一种独特的中性粒细胞样单核细胞亚群,我们称之为恶病质诱导单核细胞(CiMs),它在晚期癌症发病机制中出现并促进骨骼肌丢失。无偏转录组分析显示,产生IL36G的CD38+ CiMs在以持续性单核细胞增多和恶病质为特征的慢性单核细胞血液肿瘤发病过程中,于恶病质进展期间被诱导。CiMs的出现以及炎性单核细胞中CiM相关基因特征的激活在多种小鼠模型和晚期实体癌患者中得到证实。值得注意的是,对IL36G/IL1RL2信号的遗传抑制减弱了
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24247、10090。本站分类:肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE210001
【使用注意】
· 源站最后修改于 Oct 20 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
许多晚期癌症患者会发展为恶病质。尽管其患病率高且对生活质量和生存有灾难性影响,但导致癌症恶病质发展的关键病理生物学介质仍不明确。在此,我们展示了一种独特的中性粒细胞样单核细胞亚群,我们称之为恶病质诱导性单核细胞(CiMs),在晚期癌症发病机制中出现并促进骨骼肌丢失。无偏转录组分析揭示,产生IL36G的CD38+ CiMs在以持续性单核细胞增多和恶病质为特征的慢性单核细胞性血液肿瘤发病机制的恶病质进展过程中被诱导。CiMs的出现以及炎症性单核细胞中CiM相关基因特征的激活在多种小鼠模型和晚期实体癌患者中得到证实。值得注意的是,对IL36G/IL1RL2信号的遗传抑制减轻了骨骼肌丢失,并挽救了小鼠中由血液肿瘤和实体癌引起的恶病质表型。这些数据突显了癌症发病机制中诱导的一种中性粒细胞样单核细胞亚群的关键作用。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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