结直肠癌肝转移中CD8+ CD226high T细胞与化疗及根治术预后数据集

该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,聚焦接受化疗和根治术的结直肠癌患者肝转移灶中的 CD8+ CD226high T 细胞,用于评估 CD226 在肿瘤浸润淋巴细胞上的预后价值

geo
浏览 12
基因组预测GPL246769606
GSE207194: CD8+ CD226high T cells in liver metastases dictate the prognosis of colorectal cancer patients treated with chemotherapy and radical surgery

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-11-03

资源简介

结直肠癌肝转移中CD8+ CD226high T细胞与化疗及根治术预后数据集

CD8+ CD226high T cells in liver metastases dictate the prognosis of colorectal cancer patients treated with chemotherapy and radical surgery

该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,聚焦接受化疗和根治术的结直肠癌患者肝转移灶中的 CD8+ CD226high T 细胞,用于评估 CD226 在肿瘤浸润淋巴细胞上的预后价值。数据包含 RNAseq 表达信息,涉及原发结直肠癌与肝转移灶的免疫浸润特征,并关联 PD1、TIGIT、TIM3 等免疫检查点及 CD3 密度、CD155 等指标。可用于探索 CD226 表达与免疫微环境、患者预后之间的关系,支持结直肠癌肝转移的预后标志物与免疫相关分析(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jun 29 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):在本研究中,我们旨在评估 CD226 对接受化疗和根治术的结直肠癌(CRC)患者肝转移灶来源的肿瘤浸润淋巴细胞的预后价值。CD226high 表达与原发结直肠癌和肝转移灶 RNAseq 中强效的免疫浸润相关。CD226 表达有助于界定 CRC 肝转移灶和原发肿瘤的免疫背景。在肝转移灶中,CD8 T 细胞上的 CD226 表达并未与其他免疫检查点如 PD1、TIGIT 和 TIM3 特异性共表达。多因素 Cox 回归分析显示,CD8 T 细胞上的 CD226 表达是一个独立预后因素(p=0.003),同时浸润边缘的 CD3 密度(p=0.003)和 CD4 T 细胞上的 TIGIT 表达(p=0.019)也是独立预后因素。CD155 与 CD226 的预后价值无关。基因表达分析

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/其他。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE207194

【使用注意】

· 源站最后修改于 Feb 19 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE207194

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在本研究中,我们旨在评估CD226对接受化疗和根治性手术的结直肠癌(CRC)患者肝转移灶来源的肿瘤浸润淋巴细胞的预后价值。CD226高表达与原发性结直肠癌和肝转移灶RNAseq中强效免疫浸润相关。CD226表达有助于界定CRC肝转移灶和原发肿瘤的免疫背景。在肝转移灶中,CD8 T细胞上的CD226表达并未与其他免疫检查点如PD1、TIGIT和TIM3特异性共表达。多因素Cox回归分析显示,CD8 T细胞上的CD226表达是一个独立预后因素(p=0.003),同时浸润边缘的CD3密度(p=0.003)和CD4 T细胞上的TIGIT表达(p=0.019)也是独立预后因素。CD155与CD226的预后价值无关。验证数据集中的基因表达分析证实了CD226的预后价值选择性存在于肝转移灶中,而非原发肿瘤中。肝脏微环境中CD8+浸润淋巴细胞上CD226的下调可能通过IL-15治疗得以恢复。

CD226在肝转移灶浸润的CD8+细胞上的表达选择性地促进了对结直肠癌肝转移的免疫监视,并对接受根治性手术的患者具有预后价值。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。