小鼠胰腺癌模型单细胞水平遗传图谱
该数据集来自NCBI GEO，包含小鼠胰腺癌模型的单细胞RNA测序数据，比较对照组（EL1）与METTL3过表达组（WTg）的胰腺癌组织转录组
基本信息
资源简介
小鼠胰腺癌模型单细胞水平遗传图谱
GSE202004 数据集来自 NCBI GEO，围绕小鼠胰腺癌发生模型展开，采用单细胞水平的转录组测序手段，比较对照组（EL1）与 METTL3 过表达组（WTg）胰腺癌组织的基因表达谱。该数据集属于肿瘤领域的表达谱研究资源，以高通量测序方式获取表达数据，物种为小鼠，相关平台编号为 GPL24247。数据集由 S，Tatekawa 提交，发布时间为 May 02 202，共包含 1 个数据文件，样例文件为 GSE202004_series_matrix.txt.gz。整体而言，该数据集为研究 METTL3 表达升高对胰腺癌转录组影响提供了单细胞分辨率的原始资料。
【数据集背景】
该数据集对应的研究关注 METTL3 表达升高对小鼠胰腺癌模型的影响。源站描述指出，研究者在小鼠模型中测试了 METTL3 表达上调如何影响胰腺癌，并对来自对照组（EL1）与 METTL3 过表达组（WTg）的胰腺癌组织进行了单细胞 RNA 测序。这一背景说明数据集的核心设计是围绕 METTL3 这一因素设置对照与过表达两组的比较，从而在单细胞层面观察胰腺癌组织的基因表达特征。
【数据内容】
数据集的内容为基于单细胞水平的基因表达谱数据，来源于小鼠胰腺癌组织的单细胞 RNA 测序。数据覆盖对照组（EL1）与 METTL3 过表达组（WTg）两类样本，主题标签包括 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL24247 与 10090。数据集仅包含 1 个文件，即 GSE202004_series_matrix.txt.gz，以 GZIP 压缩格式提供。该文件为系列矩阵形式，承载样本层面的表达信息。
【采集与来源】
数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI GEO 数据库收录的数据集。源站描述说明，采集对象为小鼠胰腺癌模型的胰腺癌组织，采集手段为单细胞 RNA 测序，样本分为对照组（EL1）与 METTL3 过表达组（WTg）。数据集的作者为 S，Tatekawa，发布时间为 May 02 202。本站将其归类为肿瘤 / 其他。
【适用场景】
该数据集适用于在单细胞层面比较对照组与 METTL3 过表达组胰腺癌组织转录组差异的研究场景，可用于观察 METTL3 表达升高背景下胰腺癌组织的基因表达谱特征。由于数据来自小鼠模型，适合用于小鼠胰腺癌发生相关的基础研究。其高通量测序表达谱属性也使其可用于表达谱分析类的方法实践。具体分析目标需结合研究设计自行确定，源站未提供更细化的适用说明。
【使用方法】
使用时可下载数据文件 GSE202004_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入，以避免因格式或编码问题导致后续处理出错。源站未提供其他具体的使用步骤或分析流程。
【质量与限制】
数据集仅包含 1 个文件，文件样例为 GSE202004_series_matrix.txt.gz。源站未提供关于数据质量、测序深度、细胞数量、批次效应或质控指标的具体信息。该数据基于小鼠模型，向其他物种或人群的外推需谨慎。除此之外，源站未提供其他限制说明。
【引用与许可】
源站未提供引用方式与许可信息。使用时建议遵循 NCBI GEO 的相关使用规范，具体引用要求源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE202004
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们在小鼠模型中测试了METTL3表达升高如何影响胰腺癌。我们对来自对照组(EL1)和METTL3过表达组(WTg)的胰腺癌组织进行了单细胞RNA测序。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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