肉瘤组织解离方案偏倚单细胞与单核RNA测序转录组

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE200529

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为确定间充质来源的肿瘤——肉瘤——是否同样受技术性伪影影响，我们对源自三种侵袭性亚型（骨肉瘤、尤文肉瘤（ES）、促结缔组织增生性小圆细胞肿瘤（DSRCT））的患者来源肿瘤外植体（PDX）进行了分析。鉴于这些肉瘤亚型的罕见性，我们探索了能否通过与原发组织表型或特征性融合蛋白相关的基因表达特征，准确识别来自更广泛可获得的存档冷冻标本的单核RNA测序。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。