GSE196003：基因组分析鉴定HEY1-NCOA2融合失调的基因与通路并揭示间充质软骨肉瘤肿瘤发生

资源简介

GSE196003：基因组分析鉴定HEY1-NCOA2融合失调的基因与通路并揭示间充质软骨肉瘤肿瘤发生

GSE196003 是 NCBI GEO 上的一个高通量测序表达谱数据集，标题为“Genomic profiling identifies genes and pathways dysregulated by HEY1-NCOA2 fusion and shed a light on mesenchymal chondrosarcoma tumorigenesis”。该数据集通过表达谱分析，鉴定由 HEY1-NCOA2 融合导致失调的基因与通路，为间充质软骨肉瘤的肿瘤发生机制提供线索。数据集由 Wojciech、Rosikiewicz 提交，发布时间为 Feb 02 202，在本站归入肿瘤 / 其他分类，包含 1 个文件，样例文件为 GSE196003_series_matrix.txt.gz。

【数据集背景】

该数据集关注间充质软骨肉瘤的肿瘤发生机制。间充质软骨肉瘤是一种罕见肿瘤，HEY1-NCOA2 融合是其分子特征之一。数据集标题表明，研究通过基因组表达谱分析，识别由该融合基因导致表达失调的基因与通路，从而为理解该肿瘤的发生过程提供线索。源站描述说明，该数据集是一个 SuperSeries，由若干 SubSeries 组成，具体 SubSeries 内容源站未提供。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件，样例文件名为 GSE196003_series_matrix.txt.gz，格式为 GZIP 压缩包。主题标签包括“Expression profiling by high throughput sequencing”、GPL24676 和 9606，分别指向高通量测序表达谱、芯片平台编号和人类物种编号。数据文件的具体字段、样本数量、分组信息及表达矩阵规模等细节，源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于 NCBI GEO（ncbi.nlm.nih.gov），由 Wojciech、Rosikiewicz 提交，发布时间为 Feb 02 202。采集方法为高通量测序表达谱分析，平台编号为 GPL24676，物种为人类（9606）。样本来源、实验设计、测序策略及数据处理流程等细节，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于间充质软骨肉瘤中 HEY1-NCOA2 融合相关基因与通路失调的研究，可用于表达谱层面的差异分析、通路富集分析，以及与其他软骨肉瘤或相关肿瘤表达数据的比较研究。也可作为研究融合基因驱动肿瘤发生机制的参考数据。具体适用场景需结合源站提供的 SubSeries 信息进一步确认。

【使用方法】

使用时可下载数据文件 GSE196003_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入分析流程。由于数据集为 SuperSeries，实际分析前应查阅源站列出的 SubSeries，明确各子集对应的样本与实验条件。具体分析流程和参数设置需依据研究目的确定。

【质量与限制】

数据集为 GEO 公共数据，具体质量控制指标、测序深度、重复数及批次信息源站未提供。由于是 SuperSeries，直接使用 series matrix 文件可能不足以覆盖全部子集信息，需结合 SubSeries 使用。数据仅反映表达谱层面，不能直接推断蛋白水平或功能验证结论。样本量、肿瘤亚型构成及临床信息等限制因素源站未提供。

【引用与许可】

数据来自 NCBI GEO，引用时应注明数据集编号 GSE196003 及提交者 Wojciech、Rosikiewicz。许可条款及使用限制源站未提供，使用前应查阅 NCBI GEO 的相关政策及数据集页面说明。